More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2477 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  218  2e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  91.96 
 
 
112 aa  206  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  172  1e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  172  2e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  163  6e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  162  1e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  70.54 
 
 
112 aa  162  2e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  3.68327e-06 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  160  4e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  160  4e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  160  4e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  72.32 
 
 
112 aa  160  5e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  160  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  6.88194e-07 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  159  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  159  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  158  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
121 aa  157  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.14835e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  157  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  66.07 
 
 
112 aa  157  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  66.96 
 
 
112 aa  157  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1663  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  157  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.824699  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  157  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
117 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  157  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  157  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
117 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  67.86 
 
 
112 aa  157  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  157  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.93377e-06  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  67.86 
 
 
112 aa  156  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  157  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  8.92392e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.96 
 
 
112 aa  156  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  66.96 
 
 
112 aa  156  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  156  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  156  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  156  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  156  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  155  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  67.86 
 
 
112 aa  155  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  156  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  155  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
136 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  155  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  2.16085e-05  hitchhiker  7.91345e-07 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  155  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  155  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  1.99717e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  155  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 
112 aa  155  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
114 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  67.86 
 
 
112 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2112  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  154  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  154  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.57329e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  154  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  154  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  154  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  5e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  5e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  154  5e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  153  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  3.17831e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  153  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  66.96 
 
 
112 aa  153  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  3.37232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  153  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  153  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>