More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2389 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  394  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  48.65 
 
 
204 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  51.32 
 
 
191 aa  182  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  53.66 
 
 
186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  43.01 
 
 
204 aa  165  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  44.83 
 
 
178 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79930  predicted protein  39.81 
 
 
223 aa  162  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.529779  normal  0.351185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  40.11 
 
 
177 aa  160  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  53.66 
 
 
440 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  49.68 
 
 
196 aa  157  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  48.75 
 
 
196 aa  155  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  44.33 
 
 
196 aa  155  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  42.93 
 
 
194 aa  154  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  43.98 
 
 
197 aa  154  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  45.98 
 
 
191 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  48 
 
 
217 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  41.88 
 
 
194 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  48.41 
 
 
211 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  43.16 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  45.14 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  48.41 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  44.85 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  42.13 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  42.53 
 
 
181 aa  151  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  44.19 
 
 
184 aa  151  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  44.77 
 
 
199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  40.84 
 
 
194 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  45.24 
 
 
201 aa  150  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  41.45 
 
 
194 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  39.04 
 
 
200 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  44.71 
 
 
197 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  45.66 
 
 
207 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  47.13 
 
 
201 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  42.41 
 
 
197 aa  149  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  42.41 
 
 
194 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  44.39 
 
 
200 aa  148  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2211  hypothetical protein  47.67 
 
 
225 aa  148  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0692223 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  42.41 
 
 
194 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  47.67 
 
 
225 aa  148  5e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  44.68 
 
 
230 aa  148  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  47.8 
 
 
186 aa  148  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  44.77 
 
 
185 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  49.03 
 
 
197 aa  148  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  46.58 
 
 
207 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  45.25 
 
 
196 aa  147  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09413  hypothetical protein  39.68 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  49.68 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  45.83 
 
 
210 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  41.85 
 
 
188 aa  145  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  47.5 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  47.8 
 
 
206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  47.74 
 
 
197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0909  hypothetical protein  41.3 
 
 
189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  44.3 
 
 
201 aa  144  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  45.28 
 
 
217 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  40.34 
 
 
194 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  40.21 
 
 
193 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  42.41 
 
 
194 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  41.05 
 
 
193 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  43.32 
 
 
200 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  43.32 
 
 
200 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  44.38 
 
 
193 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  44.38 
 
 
193 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  44.38 
 
 
193 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0775  hypothetical protein  43.21 
 
 
180 aa  141  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  44.38 
 
 
193 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  41.71 
 
 
194 aa  141  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  43.37 
 
 
194 aa  141  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  47.17 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2052  hypothetical protein  47.67 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0920223  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  41.28 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  44.17 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  43.56 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  44.17 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  41.04 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  42.13 
 
 
200 aa  138  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0876  hypothetical protein  43.68 
 
 
198 aa  138  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  43.71 
 
 
193 aa  137  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  42.2 
 
 
192 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  45.4 
 
 
199 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  43.75 
 
 
193 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  38.5 
 
 
195 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  45.28 
 
 
200 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  40.22 
 
 
198 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  42.94 
 
 
180 aa  136  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5525  hypothetical protein  45.14 
 
 
183 aa  136  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  40.22 
 
 
190 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2040  hypothetical protein  37.71 
 
 
186 aa  135  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0660714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  43.87 
 
 
195 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  42.55 
 
 
197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  43.79 
 
 
188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  43.79 
 
 
188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  44.65 
 
 
199 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  43.79 
 
 
188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  43.87 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1162  hypothetical protein  41.34 
 
 
182 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  48.98 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  41.82 
 
 
195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  43.79 
 
 
195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  43.79 
 
 
195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>