More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2350 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2350  dihydropteroate synthase  100 
 
 
332 aa  661    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0932089  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  46.41 
 
 
277 aa  263  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  44.77 
 
 
277 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  44.77 
 
 
277 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  44.44 
 
 
280 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  43.79 
 
 
286 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  44.77 
 
 
277 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  44.44 
 
 
280 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  44.44 
 
 
280 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  44.44 
 
 
280 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  44.44 
 
 
280 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  44.44 
 
 
277 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  45.42 
 
 
283 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  46.13 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  45.07 
 
 
285 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  42.95 
 
 
393 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  44.01 
 
 
394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  39.94 
 
 
269 aa  225  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  41.83 
 
 
394 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  39.94 
 
 
269 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  43 
 
 
274 aa  223  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  39.74 
 
 
270 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  40.51 
 
 
399 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  41.5 
 
 
402 aa  212  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  40.27 
 
 
267 aa  212  9e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3166  dihydropteroate synthase  40.75 
 
 
418 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  39.09 
 
 
274 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  39.88 
 
 
400 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  44.55 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5983  dihydropteroate synthase  45.08 
 
 
279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0523591  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  44.41 
 
 
278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  41.86 
 
 
257 aa  196  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  38.21 
 
 
407 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  38.7 
 
 
287 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  43.45 
 
 
413 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  36.08 
 
 
397 aa  192  7e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  35.31 
 
 
412 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  37.92 
 
 
286 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  44.73 
 
 
289 aa  189  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  37.7 
 
 
290 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  39.03 
 
 
279 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  37.03 
 
 
281 aa  187  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  38.41 
 
 
286 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  33.55 
 
 
266 aa  186  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  40.19 
 
 
291 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  45.37 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  38.69 
 
 
280 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  36.74 
 
 
282 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  39.8 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1485  dihydropteroate synthase  37.99 
 
 
284 aa  182  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0106007  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  32.82 
 
 
356 aa  182  8.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  39.94 
 
 
274 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  41.64 
 
 
272 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  37.66 
 
 
282 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  38.51 
 
 
283 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  35.78 
 
 
397 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  40.76 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  39.38 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0536  dihydropteroate synthase  36.13 
 
 
267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0712347  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0549  dihydropteroate synthase  36.13 
 
 
267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  40.76 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  38.46 
 
 
283 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1766  dihydropteroate synthase  46.01 
 
 
289 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.202084  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  42.14 
 
 
303 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  33.13 
 
 
400 aa  179  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  39.49 
 
 
280 aa  179  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  36.97 
 
 
302 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  35.87 
 
 
376 aa  179  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1737  dihydropteroate synthase  36.84 
 
 
298 aa  178  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.183796  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  37.91 
 
 
277 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  39.03 
 
 
277 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1971  dihydropteroate synthase  40.13 
 
 
289 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  37.01 
 
 
276 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  37.18 
 
 
277 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  36.42 
 
 
280 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  40.71 
 
 
298 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  37.42 
 
 
277 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  37.18 
 
 
277 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2183  dihydropteroate synthase  40.13 
 
 
289 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0156937 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  39.07 
 
 
301 aa  176  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  38.71 
 
 
277 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  38.2 
 
 
283 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  38.31 
 
 
284 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  38.06 
 
 
277 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  38.71 
 
 
277 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  38.41 
 
 
311 aa  176  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  38.8 
 
 
265 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  40.74 
 
 
278 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0153  dihydropteroate synthase  35.37 
 
 
272 aa  176  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.77759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  36.31 
 
 
276 aa  175  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  38.83 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  33.01 
 
 
275 aa  175  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 
277 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  38.32 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  37.91 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0536  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0325452  unclonable  0.00000000124281 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2019  dihydropteroate synthase  37.17 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  36.54 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  36.54 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>