119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2327 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 803 aa  1633    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.54 
 
 		 737 aa  547  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  34.41 
 
 		 593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  30.45 
 
 		 556 aa  193  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.63 
 
 		 546 aa  189  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  31.03 
 
 		 569 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  29.13 
 
 		 593 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  31.38 
 
 		 604 aa  180  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.77 
 
 		 574 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 1127 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  30.88 
 
 		 649 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.36 
 
 		 596 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  32.03 
 
 		 562 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.02 
 
 		 551 aa  162  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.48 
 
 		 1189 aa  154  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  30.48 
 
 		 573 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.48 
 
 		 1208 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.68 
 
 		 600 aa  146  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.17 
 
 		 1246 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  32.16 
 
 		 577 aa  145  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  32.16 
 
 		 574 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.28 
 
 		 1114 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.09 
 
 		 1170 aa  131  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  27.02 
 
 		 583 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.37 
 
 		 1225 aa  127  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.05 
 
 		 1193 aa  125  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  30.42 
 
 		 604 aa  125  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.64 
 
 		 1236 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  27.98 
 
 		 585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  25.63 
 
 		 1088 aa  120  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.43 
 
 		 1192 aa  120  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.21 
 
 		 1226 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  29.38 
 
 		 499 aa  117  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.29 
 
 		 1066 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.81 
 
 		 1228 aa  114  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  27.23 
 
 		 655 aa  114  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  23.98 
 
 		 1183 aa  112  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  25.98 
 
 		 1208 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  25 
 
 		 1129 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.84 
 
 		 585 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  27.61 
 
 		 1098 aa  99.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  25.27 
 
 		 1109 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  30.86 
 
 		 1126 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  25.8 
 
 		 1120 aa  94  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  32.51 
 
 		 1098 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  23.32 
 
 		 1203 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  26.29 
 
 		 1107 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  28.65 
 
 		 1113 aa  89  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  26.36 
 
 		 951 aa  88.6  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  28.29 
 
 		 1166 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  24.23 
 
 		 1127 aa  86.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  23.39 
 
 		 878 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  27.03 
 
 		 590 aa  84.7  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  23.61 
 
 		 1161 aa  77.8  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 		 1184 aa  76.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.1 
 
 		 1040 aa  73.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  29.52 
 
 		 566 aa  71.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.27 
 
 		 1838 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  24.09 
 
 		 1172 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  26.05 
 
 		 685 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  26.05 
 
 		 685 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  26.15 
 
 		 691 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  32.26 
 
 		 1490 aa  68.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.05 
 
 		 8871 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  29.31 
 
 		 566 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  26.98 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  23.9 
 
 		 681 aa  65.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  26.61 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  23.45 
 
 		 668 aa  65.1  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  32.68 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6354  FG-GAP repeat protein  39.83 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.505611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  28.74 
 
 		 604 aa  64.3  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  30.41 
 
 		 4379 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.69 
 
 		 1126 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  28.8 
 
 		 974 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.96 
 
 		 453 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25.14 
 
 		 521 aa  62  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  30.47 
 
 		 2807 aa  62  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  34.41 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  24.93 
 
 		 1275 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  30.68 
 
 		 1019 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.63 
 
 		 3197 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.09 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.28 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1133 aa  58.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  28.79 
 
 		 1557 aa  57.8  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  28.82 
 
 		 645 aa  57  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  29.03 
 
 		 616 aa  57.4  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1289 aa  56.6  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.9 
 
 		 11716 aa  56.6  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.61 
 
 		 3197 aa  56.6  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  25.83 
 
 		 655 aa  55.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.07 
 
 		 1113 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  27.68 
 
 		 646 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  29.59 
 
 		 813 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  29.89 
 
 		 494 aa  51.6  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  25.94 
 
 		 554 aa  51.2  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  25.59 
 
 		 437 aa  51.2  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1104 aa  51.2  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>