59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2323 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  966    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  35.51 
 
 		 530 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  30.63 
 
 		 564 aa  182  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  34.3 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  30.36 
 
 		 492 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  28.87 
 
 		 487 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  30.09 
 
 		 514 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  27.69 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  29.77 
 
 		 502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  29.63 
 
 		 514 aa  147  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  29.75 
 
 		 509 aa  146  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  29.91 
 
 		 553 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  30.43 
 
 		 529 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  29.36 
 
 		 510 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  29 
 
 		 491 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  28.48 
 
 		 471 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  29.53 
 
 		 561 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  29.13 
 
 		 512 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  29.13 
 
 		 512 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  27.94 
 
 		 480 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  28.54 
 
 		 491 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  27.9 
 
 		 460 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  27.61 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  27.61 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  27.38 
 
 		 488 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  35.78 
 
 		 231 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  28.96 
 
 		 473 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  27.9 
 
 		 477 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  24.71 
 
 		 572 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  28.63 
 
 		 463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  25.83 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  26.72 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  26.99 
 
 		 463 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  29.68 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  25.16 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  24.88 
 
 		 511 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0965  hypothetical protein  24.86 
 
 		 555 aa  64.7  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  27.25 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  26.87 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  23.14 
 
 		 580 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  28.1 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2060  hypothetical protein  24.64 
 
 		 450 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  25.23 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  24.76 
 
 		 508 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  24.52 
 
 		 508 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  22.17 
 
 		 475 aa  54.3  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  23.12 
 
 		 498 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3039  hypothetical protein  23.71 
 
 		 480 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0289115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0587  hypothetical protein  25.23 
 
 		 518 aa  50.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.515589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2831  hypothetical protein  21.36 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625955  hitchhiker  0.000000000887118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  23.99 
 
 		 514 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0635  hypothetical protein  24.8 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.4678e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  24.29 
 
 		 514 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  23.99 
 
 		 513 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1970  hypothetical protein  31.62 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.231871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2382  hypothetical protein  27.81 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  23.53 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2220  hypothetical protein  25 
 
 		 536 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000188992  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  23.77 
 
 		 428 aa  43.5  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>