More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2195 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2195  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 220 aa  438  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  74.88 
 
 		 205 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  78.92 
 
 		 204 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238287  normal  0.209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2814  lysine exporter protein LysE/YggA  75.86 
 
 		 204 aa  290  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0715917  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  68.97 
 
 		 203 aa  279  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3213  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  72.91 
 
 		 204 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0887  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.29 
 
 		 205 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  70.16 
 
 		 203 aa  264  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  64.04 
 
 		 203 aa  261  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  62 
 
 		 202 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.46 
 
 		 203 aa  230  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  56.37 
 
 		 203 aa  228  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  55.67 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  58.82 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  51.96 
 
 		 205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0680  amino acid transporter LysE  54.9 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1052  lysine exporter protein LysE/YggA  54.19 
 
 		 203 aa  205  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0187  amino-acid exporter protein  51.26 
 
 		 204 aa  191  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.75 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2570  lysine exporter protein LysE/YggA  50.27 
 
 		 205 aa  178  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00200022  unclonable  0.0000000406824 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0505  lysine exporter protein LysE/YggA  48.24 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1665  RhtB family transporter  53 
 
 		 202 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0298  lysine exporter protein LysE/YggA  52.5 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  40.51 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  36.51 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  36.6 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  38.19 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  38.19 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  36.18 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  37.69 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  37.19 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.15 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  36.95 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.48 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  36.18 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33 
 
 		 208 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  36.18 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  35.11 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.62 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  38.69 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  36.18 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.58 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  36.18 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  36.18 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  36.18 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.5 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  32.84 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.34 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.6 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.67 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.67 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  32.67 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.98 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  32.67 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  32.67 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.83 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  32.67 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.98 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  32.67 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.87 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.65 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  32.67 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  36.95 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.45 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.97 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  36.95 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.85 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.67 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.45 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.44 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.88 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  29.44 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  29.44 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.93 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.44 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  29.44 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.44 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.44 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.44 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  33.66 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  31.38 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.12 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>