27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2117 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 221 aa  441  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  39.25 
 
 		 337 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  38.99 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  39.71 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  39.52 
 
 		 380 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  40.21 
 
 		 767 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  39.07 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  41.06 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  40.31 
 
 		 494 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  39.69 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  32.71 
 
 		 524 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  36.73 
 
 		 334 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  32.88 
 
 		 338 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  32.85 
 
 		 411 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  36.32 
 
 		 333 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  38.21 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  35.56 
 
 		 1001 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  39.58 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  32.34 
 
 		 428 aa  97.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  32.92 
 
 		 1160 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  35.75 
 
 		 692 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  28.94 
 
 		 683 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  27.69 
 
 		 357 aa  82  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  30.81 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  28.77 
 
 		 298 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1595  xylanase  26.6 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0701  UDP-glucose 4-epimerase  28.88 
 
 		 275 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.399918  normal  0.0107681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>