More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2075 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
295 aa  583  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  40.48 
 
 
326 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  40.22 
 
 
304 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  37.46 
 
 
310 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  35.62 
 
 
300 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 
318 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  39.66 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  39.66 
 
 
316 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  36.3 
 
 
298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  38.65 
 
 
302 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  36.21 
 
 
311 aa  159  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  34.78 
 
 
297 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  37.99 
 
 
345 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  38.14 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  38.14 
 
 
312 aa  155  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  37.37 
 
 
321 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  37.54 
 
 
315 aa  152  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  36.81 
 
 
316 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  37.04 
 
 
309 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  36.62 
 
 
324 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  32.09 
 
 
315 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  37.91 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  33.79 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  36.39 
 
 
317 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  34.25 
 
 
315 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  39.22 
 
 
296 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  35.64 
 
 
325 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  35.14 
 
 
301 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  36.96 
 
 
312 aa  143  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  36.93 
 
 
313 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  36.96 
 
 
353 aa  143  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  38.97 
 
 
302 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  35.25 
 
 
297 aa  143  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  38.57 
 
 
342 aa  142  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  36.43 
 
 
313 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  34.28 
 
 
302 aa  142  6e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  37.32 
 
 
328 aa  142  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  37.32 
 
 
328 aa  142  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  38.1 
 
 
317 aa  142  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  37.21 
 
 
317 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  35.54 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  33.57 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  35.23 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  39.8 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  33.8 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  35.89 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  36.59 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  33.85 
 
 
300 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  36.86 
 
 
315 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  39.1 
 
 
304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  32.89 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  34.98 
 
 
330 aa  139  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  37.23 
 
 
312 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  34.9 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  35.69 
 
 
294 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  35.07 
 
 
305 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  37.07 
 
 
296 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 
304 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  34.9 
 
 
300 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  35.11 
 
 
308 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  37.58 
 
 
306 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  34.9 
 
 
300 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  32.88 
 
 
303 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  34.9 
 
 
300 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  34.9 
 
 
300 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  34.9 
 
 
300 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  32.89 
 
 
302 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  33.67 
 
 
304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0901  protoheme IX farnesyltransferase  37.37 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0391219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  32.06 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  35.17 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  34.81 
 
 
305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  34.81 
 
 
305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 
317 aa  136  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0952  protoheme IX farnesyltransferase  37.37 
 
 
298 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  36.84 
 
 
298 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  34.77 
 
 
301 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  33.21 
 
 
301 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  36.46 
 
 
308 aa  135  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  32.28 
 
 
297 aa  135  9e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  34.11 
 
 
300 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  33.21 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 
342 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  33.21 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0950  protoheme IX farnesyltransferase  37.02 
 
 
298 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  33.46 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  33.46 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  34.47 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  34.47 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  34.47 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  34.47 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  34.47 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  34.47 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  34.47 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  35.12 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  34.6 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  34.47 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  33.1 
 
 
297 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 
306 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>