More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2072 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 425 aa  876    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  36.71 
 
 		 367 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  38.03 
 
 		 370 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  34.99 
 
 		 346 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  33.67 
 
 		 326 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  32.27 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  31.93 
 
 		 354 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  31.66 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  31.66 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  31.66 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  31.66 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  31.66 
 
 		 349 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  31.66 
 
 		 349 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  31.66 
 
 		 349 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  36.75 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  31.4 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  31.4 
 
 		 349 aa  176  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  31.4 
 
 		 349 aa  176  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  37.28 
 
 		 322 aa  173  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  34.94 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  30.83 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  31.76 
 
 		 351 aa  169  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  31.83 
 
 		 342 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  31.6 
 
 		 334 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  32.32 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  32.18 
 
 		 353 aa  168  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  31.7 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  36.92 
 
 		 318 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  32.26 
 
 		 334 aa  167  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  31.4 
 
 		 371 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  32.19 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  32.19 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  32.32 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  31.37 
 
 		 311 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  29.21 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  32.87 
 
 		 338 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  35 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  29.68 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  30.63 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  31.76 
 
 		 324 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  29.04 
 
 		 356 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  31.33 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  29.88 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  28.8 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  37.84 
 
 		 370 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  30.15 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  36.74 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  35.85 
 
 		 352 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  37.79 
 
 		 353 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  36.41 
 
 		 434 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  27.6 
 
 		 316 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  36.41 
 
 		 354 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0255  cytochrome-c oxidase  34.93 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3463  cytochrome-c oxidase  34.93 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  35.06 
 
 		 234 aa  119  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0772  quinol oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0669  quinol oxidase subunit II  29.41 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0613  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  29.41 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0614  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  29.41 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0830  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0758  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000573305 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0703  quinol oxidase subunit II  29.41 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  31.34 
 
 		 279 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 232 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0737  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  28.99 
 
 		 291 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0350513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  35.12 
 
 		 279 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0223  cytochrome c oxidase, subunit II  36.02 
 
 		 285 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0761  cytochrome c oxidase, subunit II  36.02 
 
 		 285 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  31.12 
 
 		 284 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4600  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  28.45 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00365456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  29.56 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  33.46 
 
 		 279 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  31.6 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  34.24 
 
 		 244 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  32.55 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  34.02 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  25.24 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  32.3 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0913  cytochrome-c oxidase  38.02 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214333  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  33.02 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  34.29 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  31.13 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0591  quinol oxidase AA3, subunit II  27.73 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0618  quinol oxidase AA3, subunit II  28.57 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  32.08 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  31.6 
 
 		 294 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  32.55 
 
 		 279 aa  110  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  32.55 
 
 		 279 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  31.44 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1910  cytochrome c oxidase, subunit II  31.62 
 
 		 334 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  26.23 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  30.34 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  32.53 
 
 		 235 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0899  cytochrome c oxidase, subunit II  31.55 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20634  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  30.84 
 
 		 377 aa  108  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  30.36 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  26.99 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0646  quinol oxidase, subunit II  26.13 
 
 		 374 aa  107  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519241  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  28.22 
 
 		 350 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  30.73 
 
 		 287 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>