70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2068 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  100 
 
 
273 aa  544  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  38.8 
 
 
264 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  38.17 
 
 
270 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  38.8 
 
 
265 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.82 
 
 
309 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2642  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  26.76 
 
 
301 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  27.7 
 
 
300 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3683  hypothetical protein  25.98 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3700  CtaG membrane protein  25.98 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3955  hypothetical protein  25.98 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1197  hypothetical protein  25.98 
 
 
319 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4042  hypothetical protein  25.98 
 
 
301 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3987  hypothetical protein  25.98 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4058  hypothetical protein  25.98 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4150  hypothetical protein  26.64 
 
 
301 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3852  hypothetical protein  26.64 
 
 
301 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3766  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  25.93 
 
 
301 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  34.62 
 
 
300 aa  96.3  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  32.23 
 
 
315 aa  95.9  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  34.36 
 
 
318 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  25.48 
 
 
300 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  33.5 
 
 
316 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.68 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  31.82 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  32.23 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  31.25 
 
 
298 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  32.55 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.42 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  26.67 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  28.44 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  27.66 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  30.37 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  27.9 
 
 
274 aa  59.7  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11200  membrane-like protein  32.3 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00435487  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  27.54 
 
 
671 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  26.8 
 
 
294 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  27.6 
 
 
289 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  27.27 
 
 
679 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  29.56 
 
 
651 aa  55.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  27.2 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  27.2 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  27.2 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  27.2 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  27.2 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  27.2 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  27.2 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2479  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.33 
 
 
208 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  27.31 
 
 
266 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  26.1 
 
 
691 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  31.25 
 
 
354 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.75 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  24.42 
 
 
296 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  27.31 
 
 
310 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  23.61 
 
 
280 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  27.59 
 
 
322 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  25.19 
 
 
327 aa  46.2  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  27.32 
 
 
718 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  26.58 
 
 
664 aa  45.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  25.29 
 
 
692 aa  45.8  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3384  hypothetical protein  28.11 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  27.27 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  26.06 
 
 
651 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  28.34 
 
 
711 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  26.78 
 
 
722 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  27.15 
 
 
752 aa  43.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0159  hypothetical protein  27.9 
 
 
255 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673519  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  25.97 
 
 
687 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0583  membrane protein  27.47 
 
 
275 aa  42.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.7411  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  25.29 
 
 
681 aa  42  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  25.19 
 
 
289 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>