218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2026 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  42.37 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  41.62 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  37.29 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  42.78 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  40 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  35.59 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  36.21 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  34.83 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  36.93 
 
 		 179 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  33.71 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  38.29 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  38.07 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  36.76 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  36.16 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  36.36 
 
 		 185 aa  94.7  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  30.9 
 
 		 194 aa  94.4  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  32.78 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  30.29 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  34.41 
 
 		 192 aa  91.7  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  30.9 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  32.64 
 
 		 194 aa  91.3  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  26.92 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  30.9 
 
 		 178 aa  88.6  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  30.85 
 
 		 189 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  31.07 
 
 		 178 aa  87.8  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  34.78 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  32.61 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  25.97 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 197 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 197 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  34.1 
 
 		 181 aa  84.7  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  28.65 
 
 		 178 aa  84.7  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  25.27 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  28.65 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  33.9 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  37.67 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  25.15 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  32.39 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  32.95 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  29.79 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  29.12 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  30.43 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  37.88 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  35.21 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  31.12 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  22.78 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  36.27 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  32.79 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  32.79 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  28.81 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  32.26 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  29.95 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  27.27 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  30.53 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  34.32 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  32.18 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  26.97 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  28.92 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  36.67 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  32.39 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  32.39 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  31.74 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  21.98 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  28.96 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  33.58 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  27.68 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  32.22 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  27.06 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  34.36 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  27.13 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  28.14 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  33.85 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  28.92 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  30.89 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  31.25 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  36.3 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  33.85 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  34.78 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  32.87 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  27.17 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.16 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0408  2'-5' RNA ligase  28.41 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  34.12 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  30.61 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>