26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2023 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2023  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  349  8.999999999999999e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.205777  normal  0.0399301 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0838  replication initiation regulator SeqA  27.97 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004121  SeqA protein  23.33 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000487396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2199  negative regulator of replication initiation  26.58 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1240  replication initiation regulator SeqA  21.23 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000083221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0878  regulatory protein for replication initiation in SeqA family protein  23.38 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.553189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1122  SeqA family protein  22.16 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1943  replication initiation regulator SeqA  24.04 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000703292  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2135  replication initiation regulator SeqA  24.04 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2934  SeqA family protein  21.23 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2032  replication initiation regulator SeqA  23.5 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000189513  hitchhiker  0.000121556 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2274  replication initiation regulator SeqA  23.7 
 
 		 179 aa  48.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00129565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01344  replication initiation regulator SeqA  21.11 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2239  replication initiation regulator SeqA  22.91 
 
 		 180 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000611816  hitchhiker  0.000000000629682 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2195  replication initiation regulator SeqA  22.91 
 
 		 180 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000519176  unclonable  0.00000365361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2145  replication initiation regulator SeqA  22.91 
 
 		 180 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000724209  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2335  replication initiation regulator SeqA  23.5 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2226  replication initiation regulator SeqA  22.91 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294643  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4512  replication initiation regulator SeqA  22.91 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1914  replication initiation regulator SeqA  25.64 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000265727  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1682  replication initiation regulator SeqA  25.56 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000781212  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1580  replication initiation regulator SeqA  25.69 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02554  SeqA protein  28.57 
 
 		 272 aa  44.3  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0871258  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1208  replication initiation regulator SeqA  25 
 
 		 204 aa  44.3  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1986  replication initiation regulator SeqA  29.73 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117321  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1921  replication initiation regulator SeqA  23.86 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585982  unclonable  0.00000206071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>