More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2013 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  100 
 
 
235 aa  473  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  54.47 
 
 
237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  57.26 
 
 
239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  57.26 
 
 
239 aa  267  8.999999999999999e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  57.02 
 
 
235 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  57.87 
 
 
235 aa  266  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  57.26 
 
 
238 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  57.26 
 
 
236 aa  264  7e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  54.89 
 
 
234 aa  263  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  56.84 
 
 
235 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  56.41 
 
 
259 aa  263  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  56.6 
 
 
237 aa  263  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  53.85 
 
 
234 aa  261  8e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  55.32 
 
 
234 aa  261  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 
234 aa  260  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  55.98 
 
 
236 aa  259  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  54.27 
 
 
242 aa  259  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  54.04 
 
 
239 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  55.13 
 
 
235 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  55.13 
 
 
238 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  56.78 
 
 
251 aa  258  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  55.13 
 
 
238 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.85 
 
 
238 aa  257  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  50.85 
 
 
238 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  50.85 
 
 
238 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  50.85 
 
 
238 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 
234 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 
238 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 
238 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 
238 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 
238 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 
238 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 
238 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  50.85 
 
 
238 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 
238 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  54.47 
 
 
234 aa  255  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  54.27 
 
 
238 aa  255  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  51.28 
 
 
256 aa  255  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  55.13 
 
 
233 aa  255  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  57.02 
 
 
233 aa  254  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.7 
 
 
234 aa  254  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  53.62 
 
 
237 aa  254  9e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  50.43 
 
 
238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  50 
 
 
238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  54.04 
 
 
234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  55.13 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  50.43 
 
 
238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  53.62 
 
 
235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  52.99 
 
 
236 aa  252  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  50.85 
 
 
238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  51.06 
 
 
234 aa  251  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  50.85 
 
 
238 aa  250  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  53.85 
 
 
233 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  55.13 
 
 
249 aa  249  3e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  52.99 
 
 
265 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  56.17 
 
 
245 aa  249  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  52.56 
 
 
257 aa  248  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  48.94 
 
 
236 aa  248  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  53.19 
 
 
234 aa  248  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  53.42 
 
 
235 aa  248  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.77 
 
 
235 aa  247  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  51.06 
 
 
236 aa  247  1e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  53.62 
 
 
234 aa  246  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  52.99 
 
 
258 aa  246  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  51.71 
 
 
235 aa  246  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  51.28 
 
 
244 aa  245  4e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  52.56 
 
 
233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  52.14 
 
 
286 aa  244  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.19 
 
 
236 aa  244  8e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  49.36 
 
 
238 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  52.99 
 
 
237 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  50.64 
 
 
238 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  51.46 
 
 
240 aa  242  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  57.26 
 
 
237 aa  242  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  49.79 
 
 
238 aa  242  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.34 
 
 
235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  54.04 
 
 
234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  50.85 
 
 
237 aa  241  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  54.7 
 
 
238 aa  241  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  51.05 
 
 
240 aa  241  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.91 
 
 
233 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  51.28 
 
 
237 aa  241  9e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.57 
 
 
238 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  50.63 
 
 
240 aa  240  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  51.28 
 
 
236 aa  240  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 
234 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  49.15 
 
 
238 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.49 
 
 
233 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  54.47 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  53.42 
 
 
237 aa  239  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  51.28 
 
 
237 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  51.28 
 
 
237 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  51.48 
 
 
233 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  49.15 
 
 
237 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  51.49 
 
 
236 aa  238  8e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  53.42 
 
 
234 aa  237  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  53.42 
 
 
237 aa  237  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  51.05 
 
 
233 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  49.15 
 
 
238 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  47.44 
 
 
238 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>