112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1975 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  335  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  35.56 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  31.78 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  32.58 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  31.29 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  31.03 
 
 		 1372 aa  65.5  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  36.62 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  31.82 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  29.69 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  26.57 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  28.67 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  23.13 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  30.63 
 
 		 1345 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  31.06 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  29.05 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  27.92 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  28.68 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  27.78 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  29.13 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  25.18 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  27.54 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  32.26 
 
 		 212 aa  57.4  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  27.08 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  27.59 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  26.95 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  28.15 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  25.36 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  30.33 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  30.71 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  29.08 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  27.14 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  31.13 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  25.56 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  21.99 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  30 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  27.27 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  27.89 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  31.48 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  26.76 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  25.52 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  38.27 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  31.34 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  32.52 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  25.77 
 
 		 223 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  22.9 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  34.88 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  23.64 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  23.6 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  26.06 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  26.45 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  26.47 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  22.6 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  22.6 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  23.26 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  24.79 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  25.74 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  23.53 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  25.74 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  26.23 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  23.97 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  25.9 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  25.81 
 
 		 196 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  23.12 
 
 		 197 aa  48.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  26.56 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  29.82 
 
 		 208 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  24.66 
 
 		 191 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  25.41 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  30.61 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  28.89 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  24.47 
 
 		 226 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  26.35 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  26.39 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  23.29 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  25.18 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  29.6 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  22.56 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  21.09 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  22.76 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2065  hypothetical protein  19.75 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  23.17 
 
 		 207 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  29.41 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  20.37 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  25.62 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  24.34 
 
 		 193 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  25.36 
 
 		 178 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0450  transposase  26.15 
 
 		 141 aa  44.7  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  32.56 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  33.82 
 
 		 235 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  38.37 
 
 		 222 aa  44.3  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  22.22 
 
 		 221 aa  43.9  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  22.22 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  24.14 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  29.2 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3353  protein of unknown function DUF1568  20.73 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  32.56 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  25.24 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>