More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1930 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  100 
 
 		 216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  62.68 
 
 		 227 aa  285  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  58.33 
 
 		 217 aa  284  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  57.87 
 
 		 217 aa  281  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  61.65 
 
 		 217 aa  281  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  60.65 
 
 		 217 aa  278  4e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  59.71 
 
 		 217 aa  277  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  56.94 
 
 		 217 aa  278  7e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  61.11 
 
 		 217 aa  276  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  59.22 
 
 		 217 aa  274  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  59.43 
 
 		 217 aa  269  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  55.09 
 
 		 217 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.29 
 
 		 218 aa  254  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  59.31 
 
 		 218 aa  254  8e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  59.53 
 
 		 220 aa  251  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  57.75 
 
 		 237 aa  251  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  59.8 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.02 
 
 		 209 aa  245  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.76 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  42.19 
 
 		 209 aa  173  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  44.06 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  42.65 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_002620  TC0069  endonuclease III  43.78 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  46.03 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  42.5 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  40.78 
 
 		 223 aa  164  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  44.97 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  43.48 
 
 		 287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  42.72 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  44.16 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  44.12 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  43.01 
 
 		 197 aa  161  7e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  41.75 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  41.75 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  43.63 
 
 		 270 aa  160  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  41.97 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3611  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.6 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  44.06 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  41.59 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0561  endonuclease III  43.14 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.1956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  44.39 
 
 		 235 aa  159  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  41.88 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  40.78 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  43.07 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.05 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.6 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  42.13 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  43.96 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  42.31 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  40.29 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  40.29 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  40.29 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  40.29 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  40.29 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  40.29 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  44.56 
 
 		 246 aa  158  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  43.85 
 
 		 217 aa  158  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  43.48 
 
 		 230 aa  157  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  40.29 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  43.08 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  44.21 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  41.38 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  48.33 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  42.71 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  40.98 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.78 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  40.98 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  39.39 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  43.43 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  39.22 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  41.31 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  45.08 
 
 		 230 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  40.85 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.05 
 
 		 241 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  41.94 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  40 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  42.57 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  41.58 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  42.29 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.9 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  44.17 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  42.93 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.67 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  46.28 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  42.42 
 
 		 226 aa  154  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.12 
 
 		 243 aa  154  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  42.71 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  41.67 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  44.66 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.5 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  42.21 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  43.5 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  45.56 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  43.39 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  42.56 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  42.25 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.25 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  42.36 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  40.88 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  43.68 
 
 		 260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>