17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1919 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3375  hypothetical protein  59.51 
 
 		 613 aa  680    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136335  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1996  hypothetical protein  65.27 
 
 		 900 aa  753    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17629  normal  0.339226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1918  hypothetical protein  74.05 
 
 		 607 aa  892    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1919  hypothetical protein  100 
 
 		 872 aa  1785    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3897  hypothetical protein  49.6 
 
 		 859 aa  239  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  normal  0.272372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1798  hypothetical protein  25.58 
 
 		 667 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  37.5 
 
 		 1216 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  34.91 
 
 		 1342 aa  85.9  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0557  hypothetical protein  30.98 
 
 		 295 aa  83.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  43.33 
 
 		 823 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000481721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  40.17 
 
 		 1656 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48710  predicted protein  31.31 
 
 		 969 aa  58.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.873734  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45737  predicted protein  32.5 
 
 		 882 aa  56.2  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.194505  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2330  hypothetical protein  33.6 
 
 		 865 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  24.18 
 
 		 1146 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  25.6 
 
 		 499 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  26.38 
 
 		 1096 aa  44.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>