More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1888 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1896  permease  47.17 
 
 		 810 aa  649    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  100 
 
 		 810 aa  1632    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  49.75 
 
 		 802 aa  775    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  46.97 
 
 		 805 aa  718    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  46.81 
 
 		 808 aa  685    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  42.29 
 
 		 803 aa  615  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  40.62 
 
 		 804 aa  558  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  38.17 
 
 		 798 aa  517  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  37.91 
 
 		 806 aa  458  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  36.98 
 
 		 796 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  34.84 
 
 		 814 aa  429  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  35.2 
 
 		 804 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.34 
 
 		 823 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  33.45 
 
 		 809 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  35.01 
 
 		 835 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.11 
 
 		 807 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  33.37 
 
 		 821 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  35.6 
 
 		 809 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.39 
 
 		 882 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  34.22 
 
 		 869 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.37 
 
 		 817 aa  379  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.57 
 
 		 813 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  32.36 
 
 		 845 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.32 
 
 		 807 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  36.24 
 
 		 808 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  31.14 
 
 		 797 aa  363  7.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  33.61 
 
 		 805 aa  360  4e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.94 
 
 		 822 aa  360  5e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.74 
 
 		 809 aa  360  7e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.36 
 
 		 816 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  35.44 
 
 		 803 aa  356  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  34.47 
 
 		 800 aa  356  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.25 
 
 		 871 aa  351  4e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  33.65 
 
 		 816 aa  349  9e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  32.01 
 
 		 803 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.11 
 
 		 805 aa  348  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  32.94 
 
 		 887 aa  343  7e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  32.89 
 
 		 843 aa  340  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.54 
 
 		 844 aa  339  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.05 
 
 		 805 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  31.5 
 
 		 817 aa  334  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  33.61 
 
 		 811 aa  333  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.85 
 
 		 808 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.73 
 
 		 812 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.82 
 
 		 893 aa  330  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.58 
 
 		 805 aa  328  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  34.89 
 
 		 808 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.07 
 
 		 805 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.09 
 
 		 913 aa  323  8e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  32.97 
 
 		 819 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  31.88 
 
 		 831 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.68 
 
 		 878 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.92 
 
 		 862 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.92 
 
 		 915 aa  308  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.87 
 
 		 849 aa  307  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  31.45 
 
 		 887 aa  307  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.26 
 
 		 810 aa  297  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  31.48 
 
 		 808 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  32.48 
 
 		 819 aa  293  7e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  32.93 
 
 		 865 aa  293  9e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.29 
 
 		 883 aa  292  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  30.87 
 
 		 844 aa  292  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  25.15 
 
 		 809 aa  291  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  26.58 
 
 		 810 aa  291  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  31.85 
 
 		 848 aa  291  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.07 
 
 		 855 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.54 
 
 		 874 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.29 
 
 		 879 aa  278  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.37 
 
 		 817 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  26.67 
 
 		 810 aa  273  9e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.55 
 
 		 820 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 		 813 aa  270  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.01 
 
 		 888 aa  264  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.14 
 
 		 880 aa  261  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  26.71 
 
 		 807 aa  258  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  31.29 
 
 		 861 aa  256  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.52 
 
 		 884 aa  252  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.48 
 
 		 821 aa  252  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.66 
 
 		 919 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  31.01 
 
 		 931 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.48 
 
 		 846 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.44 
 
 		 828 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 		 798 aa  151  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  27.81 
 
 		 795 aa  148  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  24.18 
 
 		 793 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  27.19 
 
 		 804 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  25.46 
 
 		 805 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  23.37 
 
 		 770 aa  136  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  24.64 
 
 		 808 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  24.02 
 
 		 795 aa  131  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  25.2 
 
 		 809 aa  130  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  24.9 
 
 		 811 aa  130  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 		 797 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3764  protein of unknown function DUF214  22.57 
 
 		 714 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 793 aa  129  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  22.9 
 
 		 805 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  23.34 
 
 		 790 aa  129  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  25.92 
 
 		 816 aa  129  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 		 803 aa  127  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 		 805 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>