More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1856 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1856  permease  100 
 
 		 887 aa  1743    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  40.05 
 
 		 817 aa  528  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.38 
 
 		 878 aa  445  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  36.04 
 
 		 869 aa  412  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  35.77 
 
 		 811 aa  389  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  35.96 
 
 		 808 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  35.04 
 
 		 865 aa  376  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  35.07 
 
 		 808 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.29 
 
 		 823 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.44 
 
 		 817 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  32.51 
 
 		 814 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.88 
 
 		 915 aa  366  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  33.53 
 
 		 802 aa  354  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.87 
 
 		 822 aa  353  5.9999999999999994e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.3 
 
 		 817 aa  350  6e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.31 
 
 		 807 aa  347  7e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  33.49 
 
 		 804 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  34.09 
 
 		 808 aa  345  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  32.7 
 
 		 798 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  35.43 
 
 		 804 aa  335  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.67 
 
 		 871 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.36 
 
 		 813 aa  331  5.0000000000000004e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.03 
 
 		 882 aa  328  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  33.61 
 
 		 796 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.39 
 
 		 855 aa  325  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.75 
 
 		 883 aa  324  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  33.33 
 
 		 805 aa  324  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.08 
 
 		 880 aa  324  5e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  32.7 
 
 		 810 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.02 
 
 		 862 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  31.78 
 
 		 887 aa  317  8e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.65 
 
 		 805 aa  316  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  30.91 
 
 		 831 aa  312  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.19 
 
 		 807 aa  312  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  31.4 
 
 		 821 aa  312  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.39 
 
 		 893 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.88 
 
 		 809 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  33.02 
 
 		 809 aa  307  7e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  32.32 
 
 		 931 aa  307  7e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  34.17 
 
 		 861 aa  303  9e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.35 
 
 		 913 aa  303  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.78 
 
 		 846 aa  301  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  33.26 
 
 		 819 aa  300  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.8 
 
 		 805 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  32.49 
 
 		 844 aa  297  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.08 
 
 		 884 aa  293  7e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  31.44 
 
 		 816 aa  291  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.81 
 
 		 805 aa  289  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  30.21 
 
 		 803 aa  286  8e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.86 
 
 		 888 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  31.23 
 
 		 809 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.25 
 
 		 844 aa  283  8.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  33.11 
 
 		 848 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.21 
 
 		 879 aa  281  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  30.17 
 
 		 797 aa  281  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  33.49 
 
 		 803 aa  280  9e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.73 
 
 		 874 aa  279  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.57 
 
 		 808 aa  277  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.66 
 
 		 805 aa  277  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.7 
 
 		 816 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  33.57 
 
 		 810 aa  275  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  31.36 
 
 		 800 aa  274  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  31.67 
 
 		 805 aa  270  8e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.73 
 
 		 849 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.35 
 
 		 821 aa  265  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  31.96 
 
 		 835 aa  263  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  31.85 
 
 		 808 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  31.52 
 
 		 843 aa  257  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  31.91 
 
 		 806 aa  257  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.18 
 
 		 919 aa  252  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.09 
 
 		 820 aa  251  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.41 
 
 		 810 aa  244  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  29.2 
 
 		 845 aa  244  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  28.92 
 
 		 803 aa  220  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.53 
 
 		 828 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.69 
 
 		 812 aa  211  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  25.79 
 
 		 813 aa  207  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  26.44 
 
 		 810 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  24.08 
 
 		 807 aa  195  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  25.54 
 
 		 810 aa  188  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  24.43 
 
 		 809 aa  183  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  29.53 
 
 		 819 aa  183  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 		 810 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  26.19 
 
 		 804 aa  147  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0658  protein of unknown function DUF214  27.52 
 
 		 793 aa  141  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442095  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  27.08 
 
 		 777 aa  140  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 		 792 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4622  protein of unknown function DUF214  28.06 
 
 		 802 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.498775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 		 788 aa  137  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  25.28 
 
 		 793 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  29.14 
 
 		 801 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  24.79 
 
 		 802 aa  132  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 		 785 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  26.76 
 
 		 813 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  27.66 
 
 		 800 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 		 793 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2599  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 		 812 aa  127  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 789 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  24.96 
 
 		 770 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  26.33 
 
 		 790 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>