83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1802 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 
179 aa  370  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  57.45 
 
 
161 aa  168  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  41.28 
 
 
165 aa  122  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  35.88 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  39.06 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  36.72 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  39.57 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  38.1 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  37.5 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  35.25 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  35.43 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  35.82 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  39.52 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  38.14 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  38.1 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  39.2 
 
 
153 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  32.14 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  30.07 
 
 
673 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  36.75 
 
 
669 aa  72.4  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  35 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  33.33 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  33.33 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  33.33 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  33.33 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  31.29 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  34.53 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  32.54 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  28.73 
 
 
722 aa  67.8  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34 
 
 
1180 aa  67.8  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  35.56 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.89 
 
 
1171 aa  67.8  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  33.33 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  34.21 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  35.71 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  29.92 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  36 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  34.06 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  34.06 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  33.33 
 
 
150 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  34.15 
 
 
158 aa  62  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  35.2 
 
 
158 aa  61.6  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  32.54 
 
 
158 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  32.54 
 
 
158 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  29.41 
 
 
148 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  38.14 
 
 
164 aa  60.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  31.39 
 
 
150 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  32.12 
 
 
150 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.79 
 
 
1265 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  37.5 
 
 
149 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.36 
 
 
1306 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  25.29 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  26.52 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  26.7 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  24.71 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.06 
 
 
1274 aa  55.1  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.25 
 
 
1390 aa  54.7  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  29.24 
 
 
159 aa  54.3  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  25.42 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  25.86 
 
 
373 aa  52  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  22.54 
 
 
164 aa  51.2  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  25.19 
 
 
272 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  24.7 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  21.79 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  31.67 
 
 
199 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  26.74 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  27.07 
 
 
181 aa  48.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  28.86 
 
 
534 aa  47.8  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  26.29 
 
 
205 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  26.14 
 
 
166 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
358 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  24.03 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  31.94 
 
 
180 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  27.78 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  27.39 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  23.81 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1483  hypothetical protein  54.55 
 
 
286 aa  42.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.200109 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  24.64 
 
 
140 aa  42  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  31.62 
 
 
176 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0966  blue (type1) copper domain-containing protein  45.16 
 
 
251 aa  41.6  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000986426  normal  0.363962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  27.33 
 
 
182 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  25.14 
 
 
162 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  25.14 
 
 
162 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>