More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1669 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  40.62 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  43.15 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.34 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.34 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  41.61 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  44.37 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  40.13 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  41.42 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  41.1 
 
 		 213 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  39.23 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  39.1 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  39.22 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  35.11 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  39.22 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  40.26 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  39.22 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  39.22 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  39.1 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  39.1 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  37.77 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  41.21 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.08 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  42.03 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 		 203 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  41.5 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  41.58 
 
 		 202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  42.54 
 
 		 195 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  37.16 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 		 206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  37.99 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  36.27 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  38.1 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.13 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  39.56 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  43.33 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  44.06 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  38.46 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  40.14 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  42 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  36.67 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  46.43 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  41.96 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  38.85 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  40 
 
 		 173 aa  112  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  45 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  38.97 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  41.26 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.18 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  37.08 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  34.55 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  40.54 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  46.27 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  44.74 
 
 		 225 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  39.46 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  37.14 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  37.58 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  41.33 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  41.61 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  39.87 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  38.26 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  41.33 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  40.66 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  36.81 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  36.36 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  36.72 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  40.3 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  38.97 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  34.78 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  35.94 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  37.16 
 
 		 217 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  38.1 
 
 		 240 aa  105  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  38.26 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  38.52 
 
 		 179 aa  105  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  38.16 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  40.25 
 
 		 210 aa  104  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  39.74 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  36.6 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  37.37 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  35.48 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.82 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  38.31 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  36.3 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  40.54 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  37.82 
 
 		 282 aa  102  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  39.63 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  34.91 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  43.7 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  42.75 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  42.75 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  43.15 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  33.56 
 
 		 184 aa  101  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  44.7 
 
 		 171 aa  101  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  42.75 
 
 		 172 aa  101  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1459  GrpE protein  39.61 
 
 		 184 aa  101  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>