More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1637 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
465 aa  929    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47 
 
 
453 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.04 
 
 
424 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.44 
 
 
417 aa  334  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  41.88 
 
 
418 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  44.64 
 
 
410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.66 
 
 
415 aa  327  3e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.46 
 
 
419 aa  325  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.377405 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  42.52 
 
 
419 aa  318  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  43.18 
 
 
429 aa  318  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.8 
 
 
414 aa  281  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.21 
 
 
453 aa  276  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.94 
 
 
478 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.36 
 
 
471 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.84 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4295  RND family efflux transporter MFP subunit  35.81 
 
 
466 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  normal  0.845427 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4285  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.99 
 
 
458 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4154  secretion protein HlyD  34.15 
 
 
458 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.63 
 
 
458 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  31.86 
 
 
459 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  32.34 
 
 
403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.14 
 
 
404 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  29.23 
 
 
444 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  31.71 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.47 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.27 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 
407 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.5 
 
 
419 aa  136  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  30.33 
 
 
402 aa  134  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  27.4 
 
 
370 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  27.4 
 
 
370 aa  126  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  27.16 
 
 
370 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  27.96 
 
 
384 aa  123  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 
419 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  27.53 
 
 
432 aa  123  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  27.79 
 
 
430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  32.38 
 
 
446 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  28.5 
 
 
413 aa  119  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  27.65 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.27 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.75 
 
 
430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  27.71 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.46 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.71 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  27.71 
 
 
416 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  27.71 
 
 
416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 
455 aa  116  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  29.18 
 
 
412 aa  116  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.79 
 
 
430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  27.94 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.74 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.53 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  26.84 
 
 
471 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  31.02 
 
 
429 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  26.25 
 
 
371 aa  114  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  26.25 
 
 
371 aa  114  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  26.25 
 
 
371 aa  114  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  26.25 
 
 
371 aa  114  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.09 
 
 
428 aa  113  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  27.97 
 
 
456 aa  113  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  27.42 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  26.25 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  26.25 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  28.05 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  26.01 
 
 
371 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.01 
 
 
371 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  26.01 
 
 
371 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  29.43 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  29.51 
 
 
392 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  28.26 
 
 
406 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  25.24 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3060  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.95 
 
 
424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  26.91 
 
 
405 aa  110  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.07 
 
 
401 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  27.91 
 
 
391 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 
409 aa  110  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.62 
 
 
400 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.32 
 
 
407 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  29.97 
 
 
489 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  26.56 
 
 
372 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 
405 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  28.62 
 
 
371 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.79 
 
 
397 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  26.56 
 
 
372 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  26.32 
 
 
372 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  26.12 
 
 
509 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  28.88 
 
 
429 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  27.07 
 
 
455 aa  107  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  28 
 
 
372 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  26.11 
 
 
425 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  24.88 
 
 
435 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  24.88 
 
 
428 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  27.71 
 
 
442 aa  106  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  26.32 
 
 
372 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  26.97 
 
 
390 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  23.99 
 
 
517 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  26.46 
 
 
397 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02838  hypothetical protein  27.3 
 
 
378 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  30.23 
 
 
433 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  26.46 
 
 
416 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>