More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1611 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 331 aa  678    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  41.07 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  35.27 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  36.93 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  36.62 
 
 		 322 aa  159  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  38.46 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  36.24 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  31.7 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  36.03 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  36.82 
 
 		 302 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  30.33 
 
 		 345 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  37.45 
 
 		 301 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  37.45 
 
 		 301 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  37.45 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  36.46 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  35.87 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  34.65 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  35.85 
 
 		 275 aa  149  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  35.98 
 
 		 275 aa  149  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.06 
 
 		 363 aa  146  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  27.04 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  32.86 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  33.88 
 
 		 417 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  26.45 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  29.04 
 
 		 335 aa  143  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  35.45 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  27.97 
 
 		 348 aa  142  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  35.23 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  29.96 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  33.46 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  30.79 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  32.58 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 380 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  34.3 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  35.25 
 
 		 386 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  29.79 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  37.55 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  29.77 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  32.43 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.68 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  31.93 
 
 		 371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1178  ApbE family protein  31.84 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  31.52 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  37.86 
 
 		 331 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.64 
 
 		 343 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.32 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  31.77 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  31.51 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  31.2 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.15 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  30.42 
 
 		 343 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  36.63 
 
 		 365 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  36.63 
 
 		 368 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  34.52 
 
 		 326 aa  129  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  27.56 
 
 		 309 aa  129  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  38.49 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  30.03 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  29.7 
 
 		 336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  31.4 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  29.89 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  31.54 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  30.38 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  33.46 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.23 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  28.26 
 
 		 370 aa  126  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  33.46 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  30.21 
 
 		 332 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  28.38 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  32.62 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  27.08 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2333  ApbE family lipoprotein  29.75 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00261528  normal  0.177607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  33.1 
 
 		 342 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  30.51 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  30.38 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.62 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  29.87 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  29.83 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.8 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  28.21 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  28.21 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  28.21 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  28.21 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  26.12 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  30.62 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  28.91 
 
 		 353 aa  119  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  31.63 
 
 		 362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  30.2 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  34.68 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  28.82 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  29.01 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  33.96 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  29.04 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  27.78 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.96 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  30.62 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1186  ApbE family lipoprotein  33.76 
 
 		 314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0352655  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>