21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1602 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1602  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
84 aa  173  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1601  excinuclease ABC subunit C  97.62 
 
 
84 aa  170  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.188108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1600  excinuclease ABC subunit C  97.62 
 
 
84 aa  170  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  40.54 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  33.75 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2985  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.23 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00056528  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  30.43 
 
 
100 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  38.67 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  32.35 
 
 
95 aa  42.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  35.06 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0098  excinuclease ABC subunit C  32.35 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807182  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  39.39 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0782  hypothetical protein  35.21 
 
 
93 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  34.85 
 
 
117 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0811  hypothetical protein  35.21 
 
 
93 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4013  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36.11 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3712  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36.11 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3578  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36.11 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  34.38 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1816  excinuclease ABC, C subunit-like protein  34.18 
 
 
79 aa  40.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  33.82 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>