201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1529 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  100 
 
 
409 aa  823  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  32.51 
 
 
397 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  32.27 
 
 
398 aa  205  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  30.1 
 
 
403 aa  190  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 
394 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 
405 aa  180  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 
394 aa  179  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  35.6 
 
 
408 aa  176  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  29.51 
 
 
395 aa  169  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  34.39 
 
 
830 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 
388 aa  146  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  32.74 
 
 
775 aa  133  7e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 
413 aa  119  1e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  23.92 
 
 
405 aa  118  2e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  27.41 
 
 
394 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 
390 aa  117  4e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  29.48 
 
 
397 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  28.26 
 
 
394 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  28.01 
 
 
394 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  25.12 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  24.88 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  26.84 
 
 
396 aa  94  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 
415 aa  93.6  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 
382 aa  85.5  2e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 
378 aa  85.5  2e-15  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  26.18 
 
 
387 aa  84.3  4e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 
193 aa  81.3  3e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 
381 aa  79.7  8e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  26.5 
 
 
379 aa  74.7  2e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  26 
 
 
379 aa  70.5  5e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  26 
 
 
379 aa  70.5  5e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.31098e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  27.41 
 
 
378 aa  70.1  7e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  26.29 
 
 
379 aa  69.7  9e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  25.66 
 
 
379 aa  69.7  9e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  25.36 
 
 
379 aa  69.3  1e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  25.14 
 
 
377 aa  68.9  1e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  24.93 
 
 
381 aa  69.3  1e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  25.66 
 
 
379 aa  69.3  1e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 
378 aa  68.6  2e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  23.74 
 
 
378 aa  68.6  2e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  25.36 
 
 
379 aa  68.6  2e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  27.5 
 
 
384 aa  68.6  2e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  25.71 
 
 
379 aa  68.6  2e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19720  hypothetical protein  24.48 
 
 
157 aa  68.9  2e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.7 
 
 
387 aa  66.6  8e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  28.69 
 
 
390 aa  66.6  8e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  1.52274e-05  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  28.62 
 
 
390 aa  65.5  2e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  26.81 
 
 
376 aa  63.9  4e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  28.05 
 
 
385 aa  64.3  4e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 
390 aa  63.9  5e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  24.1 
 
 
378 aa  63.5  6e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 
388 aa  63.5  7e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 
368 aa  62.8  1e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  23.9 
 
 
376 aa  62.8  1e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  25.3 
 
 
374 aa  62  2e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 
377 aa  61.2  3e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  23.16 
 
 
376 aa  61.2  3e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  23.16 
 
 
376 aa  61.2  3e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  23.16 
 
 
376 aa  61.2  3e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  23.16 
 
 
376 aa  61.2  3e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 
378 aa  60.1  6e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  24.9 
 
 
385 aa  59.7  9e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 
384 aa  59.3  1e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 
384 aa  59.3  1e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 
378 aa  58.5  2e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 
370 aa  58.2  2e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  23.75 
 
 
378 aa  57.8  3e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
368 aa  57.8  4e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.33 
 
 
380 aa  57.4  5e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 
366 aa  56.6  7e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  25.26 
 
 
370 aa  56.6  7e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 
368 aa  56.2  1e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.7 
 
 
384 aa  55.8  1e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2671  ABC-2 type transporter  24.57 
 
 
372 aa  55.1  2e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  2.31405e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  23.53 
 
 
377 aa  55.1  2e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.61 
 
 
906 aa  54.7  3e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  23.99 
 
 
391 aa  54.7  3e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  25.64 
 
 
382 aa  54.7  3e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  22.43 
 
 
377 aa  54.3  4e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  23.77 
 
 
368 aa  54.3  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  23.99 
 
 
391 aa  54.3  4e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  23.77 
 
 
368 aa  54.3  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  23.77 
 
 
368 aa  54.3  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  23.77 
 
 
368 aa  54.3  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  22.43 
 
 
377 aa  54.3  4e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  22.43 
 
 
377 aa  54.3  4e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0149412 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  22.43 
 
 
377 aa  54.3  4e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  22.43 
 
 
377 aa  54.3  4e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  22.43 
 
 
377 aa  54.3  4e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  23.77 
 
 
368 aa  54.3  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  22.43 
 
 
377 aa  54.3  4e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  22.43 
 
 
377 aa  53.9  5e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  23.75 
 
 
368 aa  53.9  5e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  23.75 
 
 
368 aa  53.9  5e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  23.75 
 
 
368 aa  53.9  5e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 
368 aa  53.9  5e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 
368 aa  53.9  5e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  23.98 
 
 
379 aa  53.9  5e-06  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  23.75 
 
 
368 aa  53.9  5e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  23.75 
 
 
368 aa  53.9  5e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>