More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1528 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1528  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  503  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  53.09 
 
 
251 aa  277  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  51.85 
 
 
243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  51.03 
 
 
243 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  51.85 
 
 
274 aa  270  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  48.15 
 
 
241 aa  254  7e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  47.76 
 
 
252 aa  249  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
285 aa  246  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  50.21 
 
 
248 aa  241  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  49.38 
 
 
248 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  46.8 
 
 
255 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  50.98 
 
 
260 aa  228  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  48.15 
 
 
248 aa  226  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  47.74 
 
 
248 aa  224  9e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  45.37 
 
 
273 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0114  ABC transporter related  42.57 
 
 
258 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  44.03 
 
 
246 aa  208  8e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  45 
 
 
240 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  43.57 
 
 
240 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  41.63 
 
 
251 aa  202  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3800  sodium ABC transporter ATP-binding protein  45.02 
 
 
262 aa  201  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  hitchhiker  0.00685635 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  41.74 
 
 
244 aa  201  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  41.92 
 
 
244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  41.92 
 
 
244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  39.67 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  41.05 
 
 
244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  39.26 
 
 
244 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  41.48 
 
 
244 aa  195  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3736  Na+ extrusion transport system ATP-binding protein  42.86 
 
 
249 aa  195  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  40.5 
 
 
244 aa  195  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  41.48 
 
 
244 aa  195  7e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  40.5 
 
 
244 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  40.5 
 
 
244 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  40.5 
 
 
244 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  39.67 
 
 
244 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  40.5 
 
 
244 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  41.32 
 
 
244 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  43.95 
 
 
258 aa  193  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.63 
 
 
334 aa  192  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  39.43 
 
 
279 aa  191  8e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  40.08 
 
 
244 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  36.25 
 
 
253 aa  191  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 
295 aa  189  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  41.92 
 
 
282 aa  189  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  40.81 
 
 
320 aa  188  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  36.97 
 
 
293 aa  186  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  37.86 
 
 
330 aa  185  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  40.17 
 
 
337 aa  184  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.77 
 
 
309 aa  184  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  40.18 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  37.97 
 
 
303 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  37.55 
 
 
337 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  42.11 
 
 
338 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  43.42 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 
252 aa  182  6e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.24 
 
 
312 aa  182  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  35.53 
 
 
338 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  41.2 
 
 
339 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  38.71 
 
 
332 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  41.2 
 
 
339 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.77 
 
 
316 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.37 
 
 
324 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  36.99 
 
 
259 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  35.96 
 
 
338 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.43 
 
 
324 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  40.35 
 
 
334 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  35.96 
 
 
338 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  39.17 
 
 
316 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  39.11 
 
 
334 aa  177  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  35.53 
 
 
338 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
341 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.33 
 
 
323 aa  176  4e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.44 
 
 
337 aa  175  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  38.26 
 
 
298 aa  175  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  34.17 
 
 
247 aa  175  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  39.39 
 
 
332 aa  174  9e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  36.68 
 
 
337 aa  174  9e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  36.68 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  37.45 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0458  ABC transporter related protein  39.39 
 
 
309 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  38.39 
 
 
316 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  37.12 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.74 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.17 
 
 
323 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.2 
 
 
330 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  39.09 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  36.18 
 
 
576 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.53 
 
 
279 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.44 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  38.43 
 
 
340 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  37.92 
 
 
236 aa  171  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39 
 
 
374 aa  171  7.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
356 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  37.7 
 
 
247 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  40.65 
 
 
593 aa  171  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.53 
 
 
323 aa  171  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
330 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  39.3 
 
 
337 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  40.79 
 
 
250 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  35 
 
 
247 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>