More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1497 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 253 aa  529  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  59.6 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  60 
 
 		 249 aa  315  6e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  60.47 
 
 		 250 aa  308  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  58 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  58.8 
 
 		 257 aa  306  3e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  56.13 
 
 		 253 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  58.1 
 
 		 251 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  57.71 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  58.96 
 
 		 250 aa  297  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  55.51 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  54.72 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  54.72 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  55.91 
 
 		 250 aa  295  4e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  55.12 
 
 		 252 aa  295  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  55.12 
 
 		 252 aa  295  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  55.12 
 
 		 252 aa  295  5e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  58.57 
 
 		 250 aa  295  7e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  54.72 
 
 		 252 aa  294  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  54.33 
 
 		 252 aa  291  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  53.75 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  56.08 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  54.72 
 
 		 252 aa  275  7e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  54.8 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  50.95 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.21 
 
 		 258 aa  255  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  51.76 
 
 		 259 aa  252  3e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  47.04 
 
 		 285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  44.8 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  49.61 
 
 		 248 aa  242  5e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  48.25 
 
 		 255 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  46.43 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  45.85 
 
 		 256 aa  232  6e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  44.05 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  42.91 
 
 		 254 aa  229  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  45.31 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  47.45 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  46.85 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  46.85 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  43.75 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  45.14 
 
 		 262 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  43.14 
 
 		 256 aa  225  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  42.69 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  47.45 
 
 		 336 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  44.94 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  45.74 
 
 		 257 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  43.82 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  44.71 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  45.74 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  44.49 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  40.78 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  43.08 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  43.58 
 
 		 252 aa  204  8e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  40.32 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  42.35 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  43.64 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  42.02 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  41.57 
 
 		 247 aa  202  5e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  42.97 
 
 		 252 aa  201  9e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  39.92 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1528  exonuclease III  39.71 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  39.61 
 
 		 258 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  37.84 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  41.47 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  40.48 
 
 		 254 aa  194  8.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.16 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  42.58 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  39.13 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  38.34 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  37.89 
 
 		 301 aa  191  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  38.61 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  38.34 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  39.76 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  39.76 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.08 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  37.94 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.82 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  39.13 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47361  predicted protein  35 
 
 		 489 aa  184  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  38.19 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  36.86 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1508  3'-exo-deoxyribonuclease  39.27 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000904963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  40.58 
 
 		 274 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.88161  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1090  exodeoxyribonuclease III Xth  39.29 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406253  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.86 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  36.86 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0034  exonuclease III  38.18 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  36.86 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  36.36 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  36.36 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  36.36 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  35.97 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  35.97 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  36.36 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  36.36 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  36.36 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  36.36 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>