84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1463 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 		 165 aa  322  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  53.37 
 
 		 171 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2716  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  54.88 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.653376  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4108  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.53 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.629553  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2811  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  53.66 
 
 		 171 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2630  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  54.88 
 
 		 171 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.95 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.67 
 
 		 175 aa  94  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0556  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.51 
 
 		 174 aa  84  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.94 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.97 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.57 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  32.7 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.69 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  30.97 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  31.95 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  32.08 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  38.54 
 
 		 359 aa  57.8  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.13 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.82 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.36 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.93 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.11 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  35.65 
 
 		 385 aa  52.4  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4161  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.63 
 
 		 360 aa  51.2  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.14 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  37 
 
 		 344 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.71 
 
 		 330 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  28.49 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  28.44 
 
 		 402 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  28.44 
 
 		 402 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  29.17 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  33.33 
 
 		 352 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  28.44 
 
 		 402 aa  48.5  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  31.19 
 
 		 403 aa  48.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0138382 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 334 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  33.33 
 
 		 352 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  33.33 
 
 		 352 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  33.33 
 
 		 349 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  33.33 
 
 		 352 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.76 
 
 		 345 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 352 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  32.11 
 
 		 401 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  32.11 
 
 		 401 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  32.11 
 
 		 401 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  32.11 
 
 		 401 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  32.11 
 
 		 401 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  29.79 
 
 		 408 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  33.33 
 
 		 352 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.33 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.58 
 
 		 415 aa  45.4  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0366  putative inner membrane protein  28.85 
 
 		 404 aa  44.7  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.32 
 
 		 462 aa  44.7  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3344  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.88 
 
 		 177 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 		 409 aa  44.3  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1214  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.12 
 
 		 100 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0826897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.52 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  28.44 
 
 		 404 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.85 
 
 		 412 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  31 
 
 		 408 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  27.88 
 
 		 405 aa  43.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  37.5 
 
 		 375 aa  43.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  30.43 
 
 		 404 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  30.43 
 
 		 404 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.01 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  30.43 
 
 		 404 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.87 
 
 		 352 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  30.87 
 
 		 344 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.74 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  26.54 
 
 		 359 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  26.54 
 
 		 359 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  28.26 
 
 		 404 aa  41.6  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  28.26 
 
 		 404 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0682  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.77 
 
 		 190 aa  41.6  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  28.26 
 
 		 404 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  28.26 
 
 		 404 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  28.26 
 
 		 404 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  28.26 
 
 		 404 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  28.26 
 
 		 404 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 423 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  35.96 
 
 		 343 aa  41.2  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3774  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.04 
 
 		 374 aa  40.8  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40 
 
 		 412 aa  40.8  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>