16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1426 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1426  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  567  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0198  hypothetical protein  53.18 
 
 		 261 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0181  hypothetical protein  53.18 
 
 		 261 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000193703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1913  hypothetical protein  40.96 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0617  hypothetical protein  42.01 
 
 		 273 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3042  hypothetical protein  39.93 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000144784  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08350  hypothetical protein  36.86 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2901  hypothetical protein  32.57 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  26.6 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  29.88 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0066  rhomboid family protein  26.94 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167584  normal  0.0382417 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  24.19 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  33.61 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  25.4 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  29.75 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  26.11 
 
 		 273 aa  42.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>