164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1395 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1395  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  28.7 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  32.46 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  25 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  33.17 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  40.95 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  35.58 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  28.32 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  30.14 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  29.07 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  29.33 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  26.84 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  30.81 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  26.27 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  30.94 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  33.04 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  30.05 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  40 
 
 
230 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  40 
 
 
230 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  40 
 
 
230 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  40 
 
 
230 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  35.22 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  29.41 
 
 
224 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  29.41 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  28.57 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  31.43 
 
 
184 aa  62.8  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  38.95 
 
 
235 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  42.71 
 
 
241 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  34.62 
 
 
142 aa  61.6  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  41.67 
 
 
241 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  29.77 
 
 
209 aa  61.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  38.18 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  29.49 
 
 
212 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  32.26 
 
 
254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  29.49 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  32.26 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  32.26 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  40.62 
 
 
244 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  37.37 
 
 
223 aa  58.9  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  37.11 
 
 
189 aa  58.9  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  32.26 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  32.26 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  32.26 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  32.26 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  28.91 
 
 
213 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  35.54 
 
 
236 aa  58.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  34.95 
 
 
216 aa  58.5  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2711  hypothetical protein  32.67 
 
 
206 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592555  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  31.05 
 
 
212 aa  58.2  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  39.05 
 
 
316 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  26.72 
 
 
218 aa  58.2  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  26.72 
 
 
218 aa  58.2  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  41.76 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  26.72 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  37.89 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  40.19 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  25.85 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  26.15 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  32.76 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  36.08 
 
 
210 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  38.2 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  45.74 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  36.79 
 
 
214 aa  56.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  38.89 
 
 
218 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  36.08 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  35.42 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3880  protein of unknown function DUF162  35.58 
 
 
189 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.136905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  35.71 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  32.04 
 
 
342 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  29.44 
 
 
212 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  34.58 
 
 
209 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  37.38 
 
 
209 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1094  protein of unknown function DUF162  37.63 
 
 
192 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  39.56 
 
 
239 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  39.56 
 
 
239 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  31.55 
 
 
231 aa  54.7  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  29.6 
 
 
224 aa  54.7  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  35.71 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  39.56 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  31.97 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  33.72 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  37.25 
 
 
243 aa  52.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  27.8 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  29.27 
 
 
217 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  36.36 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  28.67 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  41.05 
 
 
241 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  41.05 
 
 
241 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  41.05 
 
 
241 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  41.05 
 
 
241 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  32.98 
 
 
228 aa  52  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  27.27 
 
 
220 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  35.85 
 
 
185 aa  51.6  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  41.05 
 
 
254 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  33.01 
 
 
234 aa  51.6  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  41.05 
 
 
242 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  35.42 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  39.29 
 
 
233 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2445  protein of unknown function DUF162  35.4 
 
 
170 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  32.98 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>