233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1391 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1391  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  100 
 
 
461 aa  931    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  63.57 
 
 
471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  61.3 
 
 
481 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  60.94 
 
 
481 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  61.35 
 
 
481 aa  569  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  60.09 
 
 
471 aa  558  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0776  Zinc finger-domain-containing protein  54.32 
 
 
447 aa  490  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0781581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  55.43 
 
 
444 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  55.2 
 
 
444 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  54.75 
 
 
444 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  55.2 
 
 
444 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  55.2 
 
 
444 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.78 
 
 
442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  39.46 
 
 
441 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  36.87 
 
 
477 aa  310  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.96 
 
 
442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  38.32 
 
 
442 aa  306  7e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.55 
 
 
441 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  37.09 
 
 
478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.1 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  36.87 
 
 
478 aa  302  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  37.36 
 
 
443 aa  300  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.44 
 
 
444 aa  296  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  36.77 
 
 
442 aa  296  6e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.22 
 
 
442 aa  295  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  35.71 
 
 
466 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  37.1 
 
 
443 aa  292  7e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  34.66 
 
 
465 aa  283  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  34.88 
 
 
460 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  33.92 
 
 
459 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  34 
 
 
468 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  33.77 
 
 
468 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  33.77 
 
 
468 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  33.77 
 
 
468 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  33.77 
 
 
468 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.71 
 
 
460 aa  269  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  33.48 
 
 
460 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  33.71 
 
 
460 aa  269  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  33.41 
 
 
479 aa  269  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  33.41 
 
 
479 aa  269  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  34.23 
 
 
460 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  33.71 
 
 
460 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  34.23 
 
 
460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  34.23 
 
 
460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  34.23 
 
 
460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  33.19 
 
 
479 aa  266  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  33.48 
 
 
460 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  33.48 
 
 
460 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  33.48 
 
 
464 aa  262  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  33.33 
 
 
467 aa  260  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  32.1 
 
 
461 aa  254  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.1 
 
 
463 aa  250  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  35.84 
 
 
462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.56 
 
 
475 aa  232  9e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  29.24 
 
 
442 aa  230  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.74 
 
 
465 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31.47 
 
 
476 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.73 
 
 
448 aa  220  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.59 
 
 
471 aa  219  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1997  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.27 
 
 
477 aa  206  9e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.76 
 
 
472 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3707  sugar:cation symporter family protein  30.56 
 
 
511 aa  203  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0907  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  42.05 
 
 
538 aa  203  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000225717  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3869  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.19 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.12 
 
 
465 aa  200  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3275  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.88 
 
 
513 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03868  transport protein  29.22 
 
 
514 aa  193  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.12 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  30.47 
 
 
466 aa  189  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  30.77 
 
 
466 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  30.77 
 
 
466 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4951  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide family  30.77 
 
 
466 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.09 
 
 
468 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2372  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.32 
 
 
457 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  28.38 
 
 
454 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.7 
 
 
480 aa  167  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  27.7 
 
 
454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  29.07 
 
 
465 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1026  ribosomal protein L9  27.92 
 
 
522 aa  158  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.814155  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0789  glucuronide transporter  28.7 
 
 
469 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2602  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.14 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0020  xylose-proton symporter  25.22 
 
 
457 aa  144  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000106497  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.91 
 
 
471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1245  Na+/xyloside symporter related transporter  25.43 
 
 
467 aa  140  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4249  inner membrane symporter YihP  27.84 
 
 
460 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4294  inner membrane symporter YihP  27.84 
 
 
460 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4340  inner membrane symporter YihP  27.84 
 
 
460 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  25.11 
 
 
462 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.84 
 
 
447 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4228  inner membrane symporter YihP  27.72 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4406  inner membrane symporter YihP  27.72 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0907861  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.97 
 
 
474 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.97 
 
 
474 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.97 
 
 
474 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  24.07 
 
 
457 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  24.07 
 
 
457 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  24.07 
 
 
457 aa  136  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  24.07 
 
 
457 aa  136  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1193  Na+/xyloside symporter or related transporter  27.09 
 
 
437 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255847  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  24.2 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>