More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1368 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1368  permease  100 
 
 		 814 aa  1637    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.52 
 
 		 813 aa  523  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.66 
 
 		 817 aa  513  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  39.88 
 
 		 796 aa  498  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.96 
 
 		 882 aa  497  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  38.64 
 
 		 869 aa  492  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.68 
 
 		 823 aa  489  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  36.64 
 
 		 821 aa  476  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.47 
 
 		 807 aa  477  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.66 
 
 		 807 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  39.01 
 
 		 809 aa  463  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  38.22 
 
 		 808 aa  462  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  34.03 
 
 		 802 aa  458  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  35.65 
 
 		 805 aa  451  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  37.1 
 
 		 831 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.04 
 
 		 805 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.53 
 
 		 822 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.9 
 
 		 805 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  35.8 
 
 		 805 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  36.31 
 
 		 804 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.19 
 
 		 816 aa  438  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.5 
 
 		 805 aa  435  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  34.63 
 
 		 804 aa  432  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  33.9 
 
 		 797 aa  429  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.99 
 
 		 871 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.35 
 
 		 809 aa  428  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.76 
 
 		 883 aa  420  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.16 
 
 		 808 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  36.09 
 
 		 819 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.53 
 
 		 893 aa  412  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  37.16 
 
 		 808 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  35.34 
 
 		 798 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  35.55 
 
 		 803 aa  403  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  32.51 
 
 		 845 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  33.45 
 
 		 816 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  34.88 
 
 		 810 aa  393  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.27 
 
 		 913 aa  389  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  34.76 
 
 		 810 aa  386  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.97 
 
 		 805 aa  382  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.72 
 
 		 878 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  33.05 
 
 		 809 aa  379  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.22 
 
 		 812 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  34.47 
 
 		 887 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  34.84 
 
 		 808 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  34.11 
 
 		 817 aa  376  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  34.17 
 
 		 811 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.52 
 
 		 862 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  34.06 
 
 		 800 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.75 
 
 		 821 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  32.51 
 
 		 887 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.49 
 
 		 915 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  33.29 
 
 		 803 aa  365  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  33.54 
 
 		 865 aa  363  8e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.17 
 
 		 844 aa  360  5e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  32.88 
 
 		 803 aa  359  9e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  34.27 
 
 		 806 aa  357  3.9999999999999996e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.19 
 
 		 849 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  34.61 
 
 		 808 aa  353  5e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.37 
 
 		 919 aa  346  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  34.49 
 
 		 835 aa  340  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.4 
 
 		 817 aa  338  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.81 
 
 		 855 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.38 
 
 		 874 aa  335  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  34.38 
 
 		 848 aa  330  6e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  32.95 
 
 		 844 aa  328  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.17 
 
 		 810 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32 
 
 		 879 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  31.43 
 
 		 843 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.73 
 
 		 884 aa  308  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  33.72 
 
 		 861 aa  306  9.000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.48 
 
 		 880 aa  297  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 		 809 aa  289  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.09 
 
 		 820 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  31.36 
 
 		 819 aa  275  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  27.57 
 
 		 810 aa  272  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.37 
 
 		 888 aa  265  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.9 
 
 		 828 aa  263  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.92 
 
 		 846 aa  261  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  25.54 
 
 		 813 aa  260  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  30.91 
 
 		 931 aa  238  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 810 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  25.35 
 
 		 807 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  24.17 
 
 		 800 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 		 800 aa  148  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  25.61 
 
 		 805 aa  147  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  24.17 
 
 		 795 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  23.75 
 
 		 792 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  24.47 
 
 		 816 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  26.02 
 
 		 784 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  26.61 
 
 		 807 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  24.47 
 
 		 798 aa  141  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  26.27 
 
 		 802 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 		 813 aa  139  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  24.47 
 
 		 795 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  22.17 
 
 		 788 aa  137  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  25.44 
 
 		 790 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 		 804 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  25.54 
 
 		 798 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  24.6 
 
 		 797 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  24.26 
 
 		 797 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>