91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1366 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 
648 aa  1339    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  61.36 
 
 
580 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  57.4 
 
 
362 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.44 
 
 
315 aa  365  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.45 
 
 
505 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.48 
 
 
378 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.7 
 
 
315 aa  351  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.17 
 
 
378 aa  350  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.71 
 
 
392 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.37 
 
 
315 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.55 
 
 
316 aa  347  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  52.41 
 
 
377 aa  346  7e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  51.6 
 
 
344 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  52.66 
 
 
340 aa  332  9e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.26 
 
 
369 aa  332  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.96 
 
 
316 aa  332  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.94 
 
 
314 aa  330  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  50.94 
 
 
316 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  50.94 
 
 
316 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  50.94 
 
 
316 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  50.94 
 
 
316 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  50.63 
 
 
316 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  52.35 
 
 
341 aa  322  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.44 
 
 
426 aa  316  9e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  46.63 
 
 
333 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.01 
 
 
333 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.01 
 
 
333 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3207  glycoside hydrolase family protein  48.09 
 
 
337 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.97 
 
 
350 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2371  glycoside hydrolase family 43  40.47 
 
 
293 aa  231  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.46 
 
 
340 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.09 
 
 
347 aa  210  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1512  glycoside hydrolase family 43  41.2 
 
 
335 aa  203  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.416427 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.81 
 
 
376 aa  201  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2329  glycoside hydrolase family 43  39.77 
 
 
343 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000753035  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.71 
 
 
466 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.39 
 
 
355 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997912 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  35.49 
 
 
329 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  34.82 
 
 
607 aa  170  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2654  glycoside hydrolase family 43  40.64 
 
 
299 aa  169  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.435311  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.39 
 
 
353 aa  167  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.23 
 
 
628 aa  165  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 
507 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  35.16 
 
 
355 aa  160  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  30.14 
 
 
634 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  30.14 
 
 
634 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  30.14 
 
 
634 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  32.83 
 
 
2073 aa  154  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  31.44 
 
 
627 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  32.17 
 
 
502 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 
349 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.63 
 
 
517 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  26.26 
 
 
1278 aa  82  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  28.96 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  26.27 
 
 
699 aa  72  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  29.35 
 
 
710 aa  72  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  27.92 
 
 
495 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25.17 
 
 
334 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 
325 aa  62  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  22.94 
 
 
393 aa  61.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  27.35 
 
 
324 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
310 aa  54.7  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  25.43 
 
 
713 aa  53.9  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  24.89 
 
 
330 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  24.62 
 
 
384 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.41 
 
 
472 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  27.48 
 
 
340 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.45 
 
 
559 aa  51.2  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  24.55 
 
 
586 aa  50.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  22.54 
 
 
357 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  23.63 
 
 
317 aa  48.5  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  22.94 
 
 
338 aa  48.1  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.82 
 
 
540 aa  48.1  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25.59 
 
 
304 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  25.53 
 
 
535 aa  47.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  23.66 
 
 
539 aa  47.4  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  24.2 
 
 
319 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  22.63 
 
 
509 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  26.39 
 
 
306 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  23.21 
 
 
341 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  24.57 
 
 
524 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  22.79 
 
 
323 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 
331 aa  46.6  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  24.17 
 
 
510 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  23.91 
 
 
644 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  22.64 
 
 
345 aa  45.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.21 
 
 
444 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  24.76 
 
 
537 aa  45.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  24.05 
 
 
401 aa  45.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 
348 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  20.59 
 
 
855 aa  43.9  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0529993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>