295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1355 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  44.21 
 
 
891 aa  719    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  47.62 
 
 
903 aa  795    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
873 aa  1786    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  52.66 
 
 
986 aa  836    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  46.13 
 
 
922 aa  803    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  43.71 
 
 
813 aa  654    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  49.67 
 
 
919 aa  834    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.5 
 
 
805 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  41.82 
 
 
928 aa  597  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  40.66 
 
 
1015 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.76 
 
 
824 aa  578  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  38.3 
 
 
827 aa  559  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  44.79 
 
 
604 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  37.66 
 
 
806 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  37.26 
 
 
832 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.57 
 
 
794 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  35.23 
 
 
1355 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  34.7 
 
 
961 aa  449  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  35.76 
 
 
925 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  36.07 
 
 
932 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.84 
 
 
1781 aa  437  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  34.57 
 
 
1185 aa  435  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.59 
 
 
811 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  33.02 
 
 
984 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.44 
 
 
805 aa  422  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.82 
 
 
787 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.39 
 
 
837 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  30.72 
 
 
858 aa  389  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  32.13 
 
 
815 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.54 
 
 
808 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  33.38 
 
 
964 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 
807 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  29.85 
 
 
806 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.95 
 
 
1093 aa  360  4e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 
825 aa  360  6e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  30.74 
 
 
799 aa  351  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  31.65 
 
 
829 aa  350  7e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  29.73 
 
 
859 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  34.13 
 
 
655 aa  252  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2936  beta-galactosidase  45.49 
 
 
309 aa  243  7.999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  27.2 
 
 
862 aa  217  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.15 
 
 
882 aa  214  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  25.53 
 
 
897 aa  213  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  27.06 
 
 
888 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  27.13 
 
 
707 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  23.86 
 
 
750 aa  189  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.85 
 
 
858 aa  186  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  26.94 
 
 
704 aa  177  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 
766 aa  173  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  26.71 
 
 
894 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  27.24 
 
 
785 aa  170  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  28.11 
 
 
1171 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  22.47 
 
 
743 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  25.2 
 
 
1175 aa  167  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  25.97 
 
 
717 aa  160  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.84 
 
 
913 aa  156  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 
803 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  25.32 
 
 
804 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  26.09 
 
 
804 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  29.23 
 
 
763 aa  142  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 
754 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.19 
 
 
748 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 
781 aa  138  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.95 
 
 
781 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.41 
 
 
972 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01699  beta-galactosidase  35.56 
 
 
233 aa  134  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  25.81 
 
 
824 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 
979 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.06 
 
 
1264 aa  130  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  28.85 
 
 
1044 aa  128  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29 
 
 
747 aa  127  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  27.56 
 
 
1019 aa  126  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  27.63 
 
 
1035 aa  125  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  23.74 
 
 
598 aa  124  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  26.44 
 
 
1049 aa  124  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  23.05 
 
 
1455 aa  124  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  25.06 
 
 
1035 aa  123  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  28.82 
 
 
738 aa  124  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.54 
 
 
1289 aa  123  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  27.45 
 
 
564 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  27.21 
 
 
563 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  27.14 
 
 
1063 aa  121  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  28.33 
 
 
1094 aa  121  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  26.59 
 
 
1108 aa  121  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  28.21 
 
 
590 aa  121  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.37 
 
 
920 aa  120  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  29.09 
 
 
1050 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  29.36 
 
 
1066 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  26.07 
 
 
686 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  29.36 
 
 
1066 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.64 
 
 
1053 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  28.39 
 
 
987 aa  118  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  26.97 
 
 
1041 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.82 
 
 
598 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  25.12 
 
 
1129 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  25.98 
 
 
1084 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.04 
 
 
1329 aa  116  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  26.26 
 
 
587 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  26.59 
 
 
644 aa  115  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  29.73 
 
 
1043 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>