28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1343 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1343  YesW  100 
 
 
658 aa  1342    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  51.72 
 
 
676 aa  616  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  51.62 
 
 
1065 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  52.59 
 
 
746 aa  601  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  53.03 
 
 
820 aa  600  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.3 
 
 
833 aa  590  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  47.79 
 
 
616 aa  577  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  47.89 
 
 
914 aa  569  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  47.42 
 
 
787 aa  556  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  44.71 
 
 
1266 aa  556  1e-157  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  50.08 
 
 
744 aa  558  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  46.87 
 
 
773 aa  557  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  49.45 
 
 
743 aa  546  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  47.09 
 
 
1880 aa  542  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  46.65 
 
 
618 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  44.11 
 
 
672 aa  522  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  44.55 
 
 
677 aa  520  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  45.62 
 
 
662 aa  511  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  45.48 
 
 
613 aa  508  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  47.54 
 
 
774 aa  493  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  48.87 
 
 
669 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  36.59 
 
 
848 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  34.13 
 
 
851 aa  331  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  39.49 
 
 
1082 aa  278  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  40.05 
 
 
767 aa  263  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  38.15 
 
 
803 aa  244  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  47.08 
 
 
240 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  30.56 
 
 
606 aa  215  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>