49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1309 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1309  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 
142 aa  283  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1910  hypothetical protein  54.4 
 
 
136 aa  130  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203549  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1838  hypothetical protein  54.4 
 
 
136 aa  130  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.343418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1570  ACT domain protein  45.6 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.409737  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  35.29 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.71 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  34.65 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  33.66 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  33.66 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  31.65 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.54 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.84 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.16 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  29.41 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  29.75 
 
 
144 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  31.69 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  31.69 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.15 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  30.39 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  31.69 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  30.39 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.4 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  30.39 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  30.39 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  33.98 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  30.39 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  28.43 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  29.7 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  33.01 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.35 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.45 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.43 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.71 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  26.4 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  27.45 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  28.43 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.43 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  26.47 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.45 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  29.03 
 
 
143 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.68 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.27 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  27.45 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  29.41 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  26.47 
 
 
143 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  26.72 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  23.77 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  26.47 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  34.92 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>