283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1283 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.67 
 
 
920 aa  635  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.89 
 
 
920 aa  665  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  35.74 
 
 
951 aa  647  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
987 aa  2006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  25.41 
 
 
1019 aa  239  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  25.86 
 
 
1084 aa  224  5e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  24 
 
 
1455 aa  223  1e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  27.15 
 
 
1020 aa  222  2e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  28.92 
 
 
1043 aa  219  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.92 
 
 
1026 aa  219  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  29.55 
 
 
1129 aa  214  6e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  28.45 
 
 
1063 aa  214  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  29.04 
 
 
1003 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.86 
 
 
1018 aa  211  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.51 
 
 
1033 aa  209  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 
1049 aa  207  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  23.28 
 
 
1035 aa  204  8e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  25.13 
 
 
1024 aa  204  1e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  30.05 
 
 
1044 aa  203  1e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  25.1 
 
 
1084 aa  202  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.38 
 
 
992 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  23.81 
 
 
1079 aa  197  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  26.68 
 
 
1023 aa  194  8e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.71 
 
 
1264 aa  192  3e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  9.54733e-05  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.75 
 
 
992 aa  192  3e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 
1077 aa  191  6e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.45 
 
 
1013 aa  190  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.57 
 
 
968 aa  189  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.66 
 
 
1003 aa  187  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 
1017 aa  186  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  27.57 
 
 
1041 aa  185  4e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  24.07 
 
 
1030 aa  185  4e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  24.07 
 
 
1030 aa  185  4e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  21.16 
 
 
1043 aa  184  5e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.01 
 
 
1030 aa  184  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  23.79 
 
 
1108 aa  184  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 
1045 aa  184  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  28.37 
 
 
1020 aa  184  8e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  23.96 
 
 
1030 aa  184  9e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  23.96 
 
 
1030 aa  183  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  23.96 
 
 
1030 aa  182  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  24.07 
 
 
1030 aa  182  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  26 
 
 
1059 aa  181  5e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  7.51059e-10 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  24.97 
 
 
1035 aa  181  6e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.86 
 
 
1004 aa  181  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  27.53 
 
 
1112 aa  179  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.34 
 
 
1041 aa  179  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  22.97 
 
 
1030 aa  179  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  23.64 
 
 
1030 aa  179  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  26.46 
 
 
1008 aa  177  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.71 
 
 
996 aa  176  1e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.65 
 
 
1033 aa  176  2e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  26.28 
 
 
1076 aa  174  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.75 
 
 
1053 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  27.06 
 
 
1023 aa  173  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  22.5 
 
 
1045 aa  172  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  25.18 
 
 
1017 aa  172  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  27.07 
 
 
1026 aa  171  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  24.18 
 
 
1164 aa  169  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  31.62 
 
 
1028 aa  169  3e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  6.20353e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  27.57 
 
 
1029 aa  169  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 
1022 aa  167  6e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.98 
 
 
1424 aa  166  1e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  29.01 
 
 
1094 aa  166  2e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  26.23 
 
 
1021 aa  165  4e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  23.13 
 
 
1032 aa  164  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  25.98 
 
 
1031 aa  164  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  24.29 
 
 
1046 aa  163  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  24.51 
 
 
1030 aa  162  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26 
 
 
1005 aa  161  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26 
 
 
1036 aa  161  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  27.07 
 
 
1036 aa  161  6e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  30.19 
 
 
1024 aa  159  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.67859e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  27.69 
 
 
824 aa  159  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 
628 aa  159  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.48878e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  28.71 
 
 
1066 aa  158  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  28.71 
 
 
1066 aa  158  5e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  28.71 
 
 
1050 aa  158  5e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.87 
 
 
1329 aa  157  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  31.48 
 
 
743 aa  156  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.48 
 
 
1030 aa  156  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  30.81 
 
 
750 aa  155  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.0433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  28.11 
 
 
803 aa  155  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.51 
 
 
972 aa  155  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  29.76 
 
 
1036 aa  154  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  30 
 
 
1024 aa  153  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.19694e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  30 
 
 
1024 aa  153  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.44327e-14  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30 
 
 
1024 aa  152  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  8.77394e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  30 
 
 
1024 aa  152  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.6518e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  30 
 
 
1024 aa  152  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.75259e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  24.9 
 
 
1043 aa  151  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  27.43 
 
 
1043 aa  150  1e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.06 
 
 
858 aa  149  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  32.62 
 
 
804 aa  149  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  32.17 
 
 
832 aa  148  4e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  29.62 
 
 
1024 aa  148  4e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  2.45928e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  32.73 
 
 
804 aa  148  4e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  32.03 
 
 
766 aa  148  4e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  28.4 
 
 
806 aa  148  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.3 
 
 
1289 aa  147  9e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>