51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1241 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1241  protein of unknown function DUF883 ElaB  100 
 
 		 106 aa  202  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00670421  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1646  protein of unknown function DUF883 ElaB  41.75 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.689144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0015  putative transmembrane protein  36.04 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0870168  normal  0.721209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2791  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.59 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4252  protein of unknown function DUF883 ElaB  33.33 
 
 		 103 aa  47.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0675  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.82 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2572  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.68 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2440  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.68 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0692  protein of unknown function DUF883, ElaB  29.55 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143345  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3906  hypothetical protein  32.95 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0774  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.95 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0709  protein of unknown function DUF883 ElaB  29.55 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3187  hypothetical protein  30.68 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3225  hypothetical protein  30.68 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0811  protein of unknown function DUF883, ElaB  28.41 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865476  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0780  protein of unknown function DUF883 ElaB  28.41 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28490  hypothetical protein  30.34 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161534 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0328  protein of unknown function DUF883, ElaB  28.41 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0124  hypothetical protein  31.82 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3904  protein of unknown function DUF883, ElaB  28.41 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3240  transmembrane protein  30.68 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2067  hypothetical protein  30.68 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0843  hypothetical protein  30.68 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2676  hypothetical protein  30.68 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.470235  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1387  hypothetical protein  29.55 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1933  hypothetical protein  30.68 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650648  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0878  protein of unknown function DUF883, ElaB  27.78 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255055  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3634  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.97 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.889919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0362  putative membrane protein, ElaB-like  28.74 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0678074  normal  0.0886926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3430  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.58 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468728  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3378  hypothetical protein  30.11 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3595  protein of unknown function DUF883 ElaB  28.74 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0038891  hitchhiker  0.000000142788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1647  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.97 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266219  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2105  hypothetical protein  32.97 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178666  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18990  hypothetical protein  30.61 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4328  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.97 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2098  hypothetical protein  29.9 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3000  protein of unknown function DUF883, ElaB  29.25 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.876855  hitchhiker  0.0000209502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24770  hypothetical protein  29.9 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0060  hypothetical protein  31.91 
 
 		 104 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3039  hypothetical protein  30.12 
 
 		 105 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000238513  normal  0.059368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3174  hypothetical protein  30.12 
 
 		 105 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200573  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1134  protein of unknown function DUF883 ElaB  26.88 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2485  hypothetical protein  45.71 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2238  protein of unknown function DUF883, ElaB  31.82 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4067  hypothetical protein  30.61 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47130  hypothetical protein  30.61 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1788  hypothetical protein  30.68 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.963476  normal  0.212883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1585  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.68 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1479  hypothetical protein  30.68 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2568  hypothetical protein  26.74 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>