136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1179 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  454  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  37.89 
 
 
212 aa  129  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  37.89 
 
 
212 aa  129  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  41.76 
 
 
259 aa  122  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  33.5 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  39.04 
 
 
245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  37.43 
 
 
208 aa  113  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  35.93 
 
 
257 aa  105  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  38.73 
 
 
241 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  35.53 
 
 
235 aa  102  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  35.24 
 
 
234 aa  101  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  34.31 
 
 
229 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  32.3 
 
 
233 aa  100  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  34 
 
 
242 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  32.12 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  27.31 
 
 
230 aa  95.9  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  31.31 
 
 
219 aa  95.1  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  31.02 
 
 
234 aa  95.1  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  31.84 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  33.17 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  33.89 
 
 
235 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  31.49 
 
 
235 aa  92.8  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  31.02 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  31.84 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  31.02 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  30.05 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  34.81 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  32.61 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  29.06 
 
 
241 aa  90.1  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2909  hypothetical protein  31.55 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3296  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  89.4  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  30.14 
 
 
258 aa  89  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  28.57 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  29.65 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  29.11 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  30.21 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  27.7 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  29.05 
 
 
248 aa  85.5  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  28.7 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  28.7 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  28.08 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  28.57 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  24.86 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  30.26 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  28.89 
 
 
256 aa  82  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  29.44 
 
 
232 aa  82  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  30.29 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  31.39 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  30.15 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  30.15 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  30.15 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  29.58 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  29.15 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  26.9 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  32.62 
 
 
289 aa  78.2  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  33.66 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  28.5 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  28.69 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  27.1 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  27.1 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  28 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  28.5 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  31.79 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  28 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  31.17 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  29.78 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  30.93 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  29.07 
 
 
262 aa  72  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  25 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0438  hypothetical protein  28.73 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186047  normal  0.701848 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  27.93 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  30 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1915  hypothetical protein  25.98 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  28 
 
 
248 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0175  hypothetical protein  27.57 
 
 
251 aa  61.6  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0417  hypothetical protein  30.19 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.230267  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  31.71 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0128  hypothetical protein  27.06 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15690  hypothetical protein  26.9 
 
 
254 aa  58.5  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  28.66 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  31.62 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  29.94 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  29.11 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  29.94 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0123  hypothetical protein  30.41 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00966496  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  23.76 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  28.44 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  29.41 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  25.32 
 
 
222 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  27.51 
 
 
222 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  27.33 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1328  hypothetical protein  25.84 
 
 
204 aa  48.9  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  32.54 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1276  hypothetical protein  28.16 
 
 
172 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0147934  normal  0.415736 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  27.61 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1212  hypothetical protein  29.12 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.455556 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  25.95 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  29.27 
 
 
181 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>