More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1147 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1147  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 332 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0356763  normal  0.422182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  48.22 
 
 		 403 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  50.19 
 
 		 403 aa  265  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  42.9 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  45.03 
 
 		 405 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  39.69 
 
 		 403 aa  252  5.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  49.63 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  48.54 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  46.01 
 
 		 507 aa  247  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  37.11 
 
 		 403 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  47.88 
 
 		 403 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  43.04 
 
 		 401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  36.16 
 
 		 403 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  36.16 
 
 		 403 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  43.56 
 
 		 501 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  42.72 
 
 		 402 aa  238  8e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  40.4 
 
 		 400 aa  238  9e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  49.49 
 
 		 520 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  49.35 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  46.2 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  46.2 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  39.31 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  45.14 
 
 		 514 aa  231  9e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  35.02 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  41.01 
 
 		 537 aa  231  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  41.96 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  45.28 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  47.58 
 
 		 413 aa  229  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  38.49 
 
 		 402 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  48.21 
 
 		 404 aa  229  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  45.13 
 
 		 398 aa  229  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  46.6 
 
 		 515 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  43.46 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  44.55 
 
 		 504 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  44.55 
 
 		 504 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  46.73 
 
 		 504 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  38.16 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  40.91 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  44.53 
 
 		 403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  39.05 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  47.44 
 
 		 421 aa  225  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  44.53 
 
 		 400 aa  225  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  39.8 
 
 		 401 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  35.76 
 
 		 403 aa  224  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  47.12 
 
 		 402 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  46.49 
 
 		 412 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  48.51 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  38.34 
 
 		 408 aa  223  2e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  42.19 
 
 		 408 aa  223  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  45.7 
 
 		 506 aa  222  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  43.53 
 
 		 415 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  45.58 
 
 		 515 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  41.69 
 
 		 403 aa  219  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31740  predicted protein  43.51 
 
 		 468 aa  219  5e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.414163 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  47.44 
 
 		 415 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  41.25 
 
 		 511 aa  218  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  48.55 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  47.52 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  42.99 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  42.99 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  46.3 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  45.48 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.77 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  45.16 
 
 		 415 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2297  threonine dehydratase  42.73 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2469  threonine dehydratase  42.73 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  42.77 
 
 		 403 aa  217  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2565  threonine dehydratase  43.29 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0373564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  46.58 
 
 		 504 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2502  threonine dehydratase  42.86 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2218  threonine dehydratase  42.99 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  42.9 
 
 		 504 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  42.9 
 
 		 409 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  44.74 
 
 		 509 aa  215  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  49.49 
 
 		 530 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  38.92 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  38.92 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  48.91 
 
 		 404 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  46.25 
 
 		 504 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  45.87 
 
 		 514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  46.73 
 
 		 504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  41.46 
 
 		 514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  49.49 
 
 		 519 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  45.87 
 
 		 507 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  49.16 
 
 		 519 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  50.19 
 
 		 412 aa  212  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.66 
 
 		 323 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  45.28 
 
 		 504 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  42.59 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  45.6 
 
 		 504 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2619  threonine dehydratase  49.82 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  41.14 
 
 		 509 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  37.66 
 
 		 416 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  43.83 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  34.26 
 
 		 422 aa  210  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  38.32 
 
 		 418 aa  210  3e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  45.21 
 
 		 511 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2424  threonine dehydratase  42.22 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  45.21 
 
 		 504 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  46.08 
 
 		 504 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>