More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1135 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
716 aa  1442    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.749109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.23 
 
 
1085 aa  527  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0779  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.54 
 
 
754 aa  468  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.99 
 
 
1559 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1103  histidine kinase  52.97 
 
 
531 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.458922  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2941  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.2 
 
 
696 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843677  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
680 aa  348  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.38 
 
 
689 aa  347  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.91 
 
 
773 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2933  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 
806 aa  313  9e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.907124  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
657 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
663 aa  293  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.32 
 
 
745 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
657 aa  291  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 
652 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 
652 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1235  histidine kinase  37.41 
 
 
573 aa  270  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
816 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 
889 aa  257  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
803 aa  255  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 
674 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3575  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 
735 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
1297 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
653 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
720 aa  246  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 
708 aa  243  7.999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  35.78 
 
 
676 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
660 aa  243  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 
934 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
1331 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 
631 aa  238  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 
865 aa  238  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 
678 aa  238  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
1195 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 
663 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
955 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0173  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
824 aa  230  9e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
660 aa  228  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 
701 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
1068 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 
697 aa  226  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
1391 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 
696 aa  224  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.71 
 
 
1453 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 
835 aa  221  5e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
1808 aa  220  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  32.61 
 
 
678 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 
628 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
1501 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.6 
 
 
1214 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 
1287 aa  216  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 
930 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.57 
 
 
1220 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 
1431 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 
1002 aa  211  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 
587 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
562 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
1548 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.1 
 
 
1407 aa  207  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
1478 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
1965 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  36.53 
 
 
1399 aa  206  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
799 aa  205  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 
1330 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 
839 aa  205  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  35.43 
 
 
1384 aa  203  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
1419 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
1184 aa  203  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
519 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 
882 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.98 
 
 
1371 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 
973 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.99 
 
 
1408 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  32.8 
 
 
1287 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
662 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 
1557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
796 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
585 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  36.84 
 
 
725 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 
703 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 
1223 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.21 
 
 
1380 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  35.06 
 
 
1131 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
528 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
738 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 
667 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 
1177 aa  196  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
526 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.26 
 
 
606 aa  194  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 
1007 aa  194  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
528 aa  194  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
529 aa  194  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 
866 aa  193  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 
776 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
780 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
1222 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.02 
 
 
1079 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 
881 aa  191  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.61 
 
 
647 aa  191  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372822  normal  0.204987 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
760 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>