More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0886 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0886  recA protein  100 
 
 		 356 aa  714    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0663  recA protein  67.56 
 
 		 346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  61.08 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  60.3 
 
 		 358 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  61.38 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  60.12 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  57.72 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  59.5 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  59.94 
 
 		 357 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  60.48 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  59.1 
 
 		 356 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  61.44 
 
 		 344 aa  415  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  58.23 
 
 		 348 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  61.18 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  58.91 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  58.23 
 
 		 348 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  58.21 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  58.77 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  56.56 
 
 		 347 aa  411  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  58.28 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  59.58 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  61.25 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  61.25 
 
 		 363 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  61.56 
 
 		 366 aa  408  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  62.19 
 
 		 355 aa  408  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3045  recombinase A  59.08 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  58.51 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  58.51 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  61.25 
 
 		 361 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  57.68 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  58.23 
 
 		 358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  56.84 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  60 
 
 		 362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  59.2 
 
 		 364 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  58.18 
 
 		 346 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  58.11 
 
 		 350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  60.62 
 
 		 363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  59.26 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  61.99 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  58.08 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  59.69 
 
 		 335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  59.94 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  60 
 
 		 362 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  57.54 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  60.76 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  57.85 
 
 		 364 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  60.62 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  61.08 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  57.39 
 
 		 362 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  57.78 
 
 		 364 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  60.06 
 
 		 341 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  58.46 
 
 		 343 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  59.75 
 
 		 348 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  60 
 
 		 364 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  59.06 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  58.75 
 
 		 357 aa  401  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  60 
 
 		 363 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  62.89 
 
 		 346 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  55.33 
 
 		 378 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  60.76 
 
 		 424 aa  401  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  56.97 
 
 		 345 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  60.44 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  58.05 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  56.36 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  56.97 
 
 		 347 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  57.27 
 
 		 376 aa  398  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  57.58 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  61.9 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  56.84 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  61.9 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  61.9 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  61.9 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  57.66 
 
 		 343 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  61.9 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  61.9 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  57.23 
 
 		 345 aa  398  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  56.36 
 
 		 347 aa  398  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  61.39 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  59.38 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  61.9 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  60.62 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  61.18 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  61.9 
 
 		 357 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  56.36 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  57.61 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  56.62 
 
 		 365 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  57.4 
 
 		 351 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  57.23 
 
 		 350 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  60.31 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  61.27 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  60.76 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3750  recA protein  62.42 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.79987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  61.22 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  61.59 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  61.59 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  58.62 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  61.08 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  56.43 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  61.56 
 
 		 345 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  55.89 
 
 		 383 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>