114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0854 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  100 
 
 
1607 aa  3202    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35.42 
 
 
1507 aa  746    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  57.93 
 
 
1383 aa  388  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.25 
 
 
826 aa  376  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.52 
 
 
805 aa  358  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  45.42 
 
 
1026 aa  351  8e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  51.02 
 
 
540 aa  350  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  59.52 
 
 
1176 aa  349  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  53.91 
 
 
714 aa  348  5e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.74 
 
 
1221 aa  347  8e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.2 
 
 
1126 aa  340  9e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  54.49 
 
 
633 aa  337  7.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55 
 
 
810 aa  335  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  54.39 
 
 
1255 aa  330  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  53.24 
 
 
1195 aa  330  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  54.14 
 
 
701 aa  327  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  50.72 
 
 
1178 aa  325  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  53.5 
 
 
884 aa  324  8e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  52.05 
 
 
1848 aa  323  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  52.23 
 
 
408 aa  322  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  53.04 
 
 
2802 aa  313  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  50.72 
 
 
920 aa  313  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  46.83 
 
 
721 aa  308  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  57.63 
 
 
1285 aa  303  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.23 
 
 
1130 aa  300  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.96 
 
 
1183 aa  299  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.42 
 
 
1292 aa  295  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  47.81 
 
 
640 aa  292  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.59 
 
 
887 aa  291  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  54.42 
 
 
1176 aa  290  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  49.85 
 
 
791 aa  286  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  49.58 
 
 
933 aa  281  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  48.25 
 
 
862 aa  278  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  46.5 
 
 
462 aa  277  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  46.06 
 
 
664 aa  276  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  44.71 
 
 
3563 aa  246  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  46.29 
 
 
648 aa  227  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  42.35 
 
 
288 aa  191  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  29.54 
 
 
1969 aa  182  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  29.74 
 
 
2713 aa  162  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  40.74 
 
 
1083 aa  145  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  45.98 
 
 
14944 aa  119  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  29.57 
 
 
3793 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  27.65 
 
 
1329 aa  114  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  30.71 
 
 
1108 aa  112  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.74 
 
 
1657 aa  104  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  27.32 
 
 
1288 aa  97.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  29.89 
 
 
1247 aa  85.5  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  28.44 
 
 
910 aa  84  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  29.57 
 
 
991 aa  81.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  25.5 
 
 
1750 aa  80.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  29.36 
 
 
1474 aa  80.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 
1132 aa  79.7  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  29.13 
 
 
1585 aa  77  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  29.13 
 
 
1217 aa  76.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  41.18 
 
 
1550 aa  74.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  27.5 
 
 
904 aa  71.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  26.73 
 
 
1266 aa  69.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  24.58 
 
 
2024 aa  66.6  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.73 
 
 
1362 aa  67  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  29.93 
 
 
1976 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  26.89 
 
 
1079 aa  65.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04803  hypothetical protein  50 
 
 
441 aa  64.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.151498 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  27.01 
 
 
1002 aa  63.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  24.05 
 
 
2402 aa  62.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  37.17 
 
 
2003 aa  62.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  26.45 
 
 
799 aa  62.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  23.66 
 
 
5453 aa  61.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1083  immunoglobulin I-set domain protein  39.36 
 
 
134 aa  61.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  28.38 
 
 
1170 aa  60.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2176  major tail protein  36.17 
 
 
238 aa  60.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2886  major tail protein  36.17 
 
 
238 aa  60.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3244  Immunoglobulin I-set domain protein  29.51 
 
 
532 aa  59.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000478897  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  35.42 
 
 
1100 aa  59.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  26.39 
 
 
3834 aa  57.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  25.82 
 
 
1345 aa  58.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  41.86 
 
 
972 aa  58.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  24.46 
 
 
822 aa  57  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0992  putative Vgr-related protein  27.56 
 
 
979 aa  55.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  26.13 
 
 
2411 aa  54.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0373  hypothetical protein  28.43 
 
 
496 aa  55.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  28.26 
 
 
815 aa  54.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.53 
 
 
1343 aa  54.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  29.86 
 
 
1295 aa  53.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  25.49 
 
 
2262 aa  53.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0991  hypothetical protein  26.74 
 
 
760 aa  53.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.021624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  26.13 
 
 
2367 aa  53.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  25.94 
 
 
2807 aa  53.5  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  26.27 
 
 
1094 aa  52.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  26.38 
 
 
2454 aa  52.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  25.69 
 
 
1771 aa  52.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  26.38 
 
 
2421 aa  52  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3335  hypothetical protein  29.75 
 
 
577 aa  52  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304879  normal  0.237472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1423  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.64 
 
 
139 aa  52  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  25.44 
 
 
792 aa  51.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  28.05 
 
 
1356 aa  51.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  24.86 
 
 
1059 aa  50.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  26.08 
 
 
808 aa  50.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  26.92 
 
 
2270 aa  49.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  29.02 
 
 
994 aa  49.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>