294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0791 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
808 aa  1622  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.32 
 
 
837 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.77 
 
 
246 aa  198  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.51 
 
 
246 aa  194  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.45 
 
 
283 aa  194  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.72 
 
 
242 aa  192  3e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.91 
 
 
266 aa  190  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.98 
 
 
257 aa  188  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.21 
 
 
242 aa  187  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44 
 
 
328 aa  184  5e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44 
 
 
328 aa  184  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.74 
 
 
242 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  42.28 
 
 
245 aa  176  1e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.11 
 
 
279 aa  174  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.83 
 
 
249 aa  150  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.59 
 
 
249 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.4 
 
 
260 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.6 
 
 
264 aa  129  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 
244 aa  125  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.02 
 
 
228 aa  119  2e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.37 
 
 
261 aa  116  2e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.37 
 
 
261 aa  116  2e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.7 
 
 
258 aa  116  2e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.02 
 
 
226 aa  115  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.96 
 
 
282 aa  113  1e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.4 
 
 
263 aa  113  2e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.4 
 
 
263 aa  113  2e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.19 
 
 
236 aa  112  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.43 
 
 
231 aa  112  4e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.27 
 
 
265 aa  110  8e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.39 
 
 
278 aa  109  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1543  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.16 
 
 
724 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.199855 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.11 
 
 
281 aa  104  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.81 
 
 
258 aa  104  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.86 
 
 
269 aa  104  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.99 
 
 
250 aa  104  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.61 
 
 
278 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.86 
 
 
269 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3383  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.3 
 
 
671 aa  102  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.835813  normal  0.7475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.04 
 
 
232 aa  102  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  34.17 
 
 
273 aa  102  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.22 
 
 
255 aa  101  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.08 
 
 
244 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.68 
 
 
287 aa  97.8  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.55 
 
 
292 aa  97.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.72 
 
 
259 aa  96.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0008  hypothetical protein  32.24 
 
 
244 aa  96.3  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.26697e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
247 aa  94.7  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.91 
 
 
266 aa  94.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  4.83065e-08 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.07 
 
 
246 aa  92.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.21 
 
 
271 aa  91.3  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.47 
 
 
282 aa  90.9  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.33 
 
 
233 aa  90.1  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.69 
 
 
338 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.1 
 
 
289 aa  89.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  31.45 
 
 
639 aa  88.6  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 
278 aa  88.6  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  34.69 
 
 
338 aa  88.2  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.51 
 
 
253 aa  87.8  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 
265 aa  86.7  2e-15  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.27 
 
 
285 aa  86.3  2e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.79 
 
 
283 aa  86.7  2e-15  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.13 
 
 
285 aa  85.5  3e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.35 
 
 
312 aa  85.5  4e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2964  membrane protein of unknown function  26.91 
 
 
697 aa  85.5  4e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506819  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.69 
 
 
1153 aa  85.1  5e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.44 
 
 
269 aa  83.6  1e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34 
 
 
260 aa  83.6  2e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.73 
 
 
285 aa  83.2  2e-14  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.8 
 
 
639 aa  83.2  2e-14  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  32.68 
 
 
286 aa  83.2  2e-14  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.98 
 
 
591 aa  82.4  3e-14  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4171  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.2 
 
 
655 aa  82  4e-14  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.98 
 
 
253 aa  80.1  2e-13  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  34.43 
 
 
277 aa  78.6  4e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.09 
 
 
300 aa  78.6  5e-13  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.92 
 
 
235 aa  78.6  5e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.19 
 
 
243 aa  78.2  6e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.92 
 
 
231 aa  77.4  9e-13  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0339  membrane protein of unknown function  23.73 
 
 
715 aa  77.4  1e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.69 
 
 
299 aa  76.6  2e-12  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.8 
 
 
644 aa  76.3  2e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.69 
 
 
271 aa  76.3  2e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.89 
 
 
271 aa  75.5  4e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  27.1 
 
 
257 aa  75.5  4e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  27.1 
 
 
257 aa  75.1  5e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.54 
 
 
250 aa  74.7  6e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  28.63 
 
 
302 aa  73.9  1e-11  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.15 
 
 
245 aa  73.2  2e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.19 
 
 
298 aa  72.8  2e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 
248 aa  73.2  2e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.95 
 
 
276 aa  73.2  2e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34924e-06 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  29.46 
 
 
617 aa  72.8  2e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 
576 aa  72.8  2e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  30.83 
 
 
248 aa  72.8  3e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.88 
 
 
277 aa  72.8  3e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0876  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.09 
 
 
252 aa  72  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.09 
 
 
252 aa  72  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00426171  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0908  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.09 
 
 
252 aa  72  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0961  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.09 
 
 
252 aa  72  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>