65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0712 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 634 aa  1257    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  38.82 
 
 		 166 aa  75.1  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2176  hypothetical protein  29.81 
 
 		 587 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.1659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  35.29 
 
 		 152 aa  71.2  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  32.68 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  35.14 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  34.09 
 
 		 154 aa  64.7  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  35.44 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2265  hypothetical protein  30.75 
 
 		 586 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.030123  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  33.09 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  31.16 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1680  hypothetical protein  29.19 
 
 		 587 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441458  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  35.37 
 
 		 196 aa  60.1  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2124  secretin/TonB short domain  32.04 
 
 		 575 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0909641  normal  0.0183027 
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  38.55 
 
 		 198 aa  59.3  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 159 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  32.93 
 
 		 195 aa  58.5  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  34.67 
 
 		 154 aa  57  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  28.38 
 
 		 295 aa  54.3  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1038  hypothetical protein  24.54 
 
 		 357 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1143  protein of unknown function DUF583  24.06 
 
 		 356 aa  51.6  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.258577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  30.34 
 
 		 165 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  31.03 
 
 		 165 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  28.89 
 
 		 170 aa  51.2  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  30.65 
 
 		 137 aa  50.8  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0337  hypothetical protein  34.75 
 
 		 501 aa  50.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0243705  normal  0.0445398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  31.17 
 
 		 165 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  30.93 
 
 		 406 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  29.8 
 
 		 187 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0865  hypothetical protein  35.88 
 
 		 355 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685933  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  26.06 
 
 		 257 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  32.58 
 
 		 157 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  30.59 
 
 		 162 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  27.84 
 
 		 310 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  32.91 
 
 		 163 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  29.41 
 
 		 162 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  33.82 
 
 		 141 aa  47  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  31.17 
 
 		 141 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0026  hypothetical protein  25.84 
 
 		 361 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  26.87 
 
 		 185 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1911  hypothetical protein  25.89 
 
 		 366 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5191  RDD domain containing protein  35.53 
 
 		 157 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1078  RDD domain-containing protein  26.92 
 
 		 191 aa  46.6  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5636  RDD domain-containing protein  37.66 
 
 		 147 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  27.27 
 
 		 145 aa  45.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  41.54 
 
 		 156 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0346  protein of unknown function DUF583  26.4 
 
 		 348 aa  45.8  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  29.37 
 
 		 135 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3843  hypothetical protein  27.93 
 
 		 315 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262125  decreased coverage  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  30.43 
 
 		 150 aa  45.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  26.47 
 
 		 151 aa  45.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  30.43 
 
 		 150 aa  45.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0555  hypothetical protein  27.99 
 
 		 366 aa  44.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  28.24 
 
 		 162 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  28.24 
 
 		 162 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  34.38 
 
 		 202 aa  44.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  24.11 
 
 		 185 aa  44.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2043  hypothetical protein  30.93 
 
 		 296 aa  44.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000518582  hitchhiker  0.00000000582876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  32.19 
 
 		 214 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  28.24 
 
 		 162 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  28.99 
 
 		 150 aa  44.7  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  24.18 
 
 		 163 aa  44.7  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  33.33 
 
 		 216 aa  43.9  0.01  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  37.68 
 
 		 149 aa  43.9  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>