More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0627 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 369 aa  760    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  62.4 
 
 		 390 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  56.64 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  50.14 
 
 		 379 aa  364  1e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  47.59 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  47.8 
 
 		 400 aa  349  4e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  46.05 
 
 		 397 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  49.47 
 
 		 421 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  50 
 
 		 405 aa  330  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  43.36 
 
 		 387 aa  304  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  42.82 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  42.36 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  41.89 
 
 		 389 aa  276  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  42.55 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  42.59 
 
 		 397 aa  273  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  45.01 
 
 		 397 aa  272  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  42.62 
 
 		 395 aa  272  8.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  38.52 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  38.52 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  38.8 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  38.52 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  43.4 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  41.35 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  39.29 
 
 		 389 aa  258  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  39.07 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1783  aminotransferase class I and II  40.54 
 
 		 390 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  41.69 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  42.2 
 
 		 401 aa  256  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  38.96 
 
 		 382 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  39.34 
 
 		 387 aa  255  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  37.98 
 
 		 382 aa  255  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4927  putative aminotransferase  38.74 
 
 		 393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  40.93 
 
 		 409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  37.91 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  40.93 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  41.94 
 
 		 413 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  37.33 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.36 
 
 		 385 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  40.92 
 
 		 382 aa  253  6e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  38.46 
 
 		 383 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.05 
 
 		 402 aa  252  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  38.46 
 
 		 383 aa  252  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  38.9 
 
 		 391 aa  252  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  39.84 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1353  aspartate aminotransferase  39.73 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  39.46 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  40.53 
 
 		 395 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  39.46 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  41.11 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  40.98 
 
 		 384 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  39.02 
 
 		 385 aa  249  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  39.78 
 
 		 391 aa  249  7e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  37.6 
 
 		 394 aa  249  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  37.7 
 
 		 382 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00190  aminotransferase, putative  36.92 
 
 		 460 aa  248  9e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00967249  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  40.11 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  42.55 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  38.04 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3334  putative aminotransferase  39.12 
 
 		 385 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.946068  hitchhiker  0.000376908 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  38.04 
 
 		 386 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  37.77 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  37.16 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  37.77 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  41.3 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  39.24 
 
 		 393 aa  246  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  37.19 
 
 		 382 aa  245  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  36.68 
 
 		 386 aa  245  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  36.68 
 
 		 386 aa  245  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  37.91 
 
 		 399 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  37.77 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  37.77 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0642  putative aminotransferase  37.23 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  37.77 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  36.61 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1558  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0317788  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  36.81 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  35.16 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  36.81 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  37.23 
 
 		 386 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  36.41 
 
 		 386 aa  243  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  37.23 
 
 		 386 aa  243  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  38.4 
 
 		 385 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  36.61 
 
 		 382 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  37.23 
 
 		 386 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0656  putative aminotransferase  37.23 
 
 		 389 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  37.23 
 
 		 386 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  37.23 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.26 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  36.68 
 
 		 385 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  40.77 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  36.66 
 
 		 385 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  37.09 
 
 		 388 aa  240  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  39.13 
 
 		 387 aa  239  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  39.01 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  38.04 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  39.18 
 
 		 394 aa  238  9e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  40.22 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  37.94 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1559  putative aminotransferase  38.08 
 
 		 410 aa  237  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000413042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>