62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0618 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0618  hypothetical protein  100 
 
 
710 aa  1456    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2277  dipeptidyl-peptidase 7  46.28 
 
 
701 aa  599  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3411  hypothetical protein  47.67 
 
 
713 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490577  normal  0.207662 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3425  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  44.97 
 
 
706 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00839556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3344  dipeptidyl-peptidase 7  44.03 
 
 
706 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3489  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  44.67 
 
 
706 aa  512  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0494  hypothetical protein  41.31 
 
 
688 aa  484  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2591  dipeptidyl-peptidase 7  41.32 
 
 
714 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5737  Peptidase S46  36.9 
 
 
711 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1178  Dipeptidyl-peptidase 7  37.87 
 
 
751 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1179  dipeptidyl-peptidase 7  33.19 
 
 
759 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1344  hypothetical protein  31.82 
 
 
732 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818075  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5731  Peptidase S46  29.52 
 
 
786 aa  226  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521337  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0416  hypothetical protein  26.78 
 
 
714 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0905126  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0949  dipeptidyl-peptidase 7  28.11 
 
 
718 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0576142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3025  dipeptidyl-peptidase 7  28.11 
 
 
718 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0692  hypothetical protein  28.4 
 
 
731 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0959  hypothetical protein  28.07 
 
 
716 aa  219  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00114251  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0913  dipeptidyl-peptidase 7  27.93 
 
 
718 aa  216  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365403  normal  0.893813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2984  hypothetical protein  27.39 
 
 
722 aa  214  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3464  hypothetical protein  28.23 
 
 
718 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3979  hypothetical protein  30.32 
 
 
715 aa  209  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137716  normal  0.400863 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0917  hypothetical protein  27.62 
 
 
718 aa  209  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.14142  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1283  hypothetical protein  27.41 
 
 
720 aa  209  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0898  hypothetical protein  28.09 
 
 
718 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3388  hypothetical protein  28.37 
 
 
718 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3587  hypothetical protein  28.27 
 
 
718 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115853  normal  0.956669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0849  hypothetical protein  26.92 
 
 
718 aa  207  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0684  hypothetical protein  28.26 
 
 
718 aa  206  9e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0176519  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0642  hypothetical protein  28.22 
 
 
718 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605544  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1075  hypothetical protein  27.34 
 
 
718 aa  206  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0715  hypothetical protein  27.08 
 
 
732 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3877  hypothetical protein  26.6 
 
 
718 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.286815  hitchhiker  0.0000320991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5484  Peptidase S46  29.5 
 
 
767 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0736  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  27.21 
 
 
732 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00943685  hitchhiker  0.00000000353181 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0745  hypothetical protein  26.94 
 
 
732 aa  204  7e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00110202  hitchhiker  0.000231819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3937  hypothetical protein  26.54 
 
 
718 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.631088  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3639  hypothetical protein  26.68 
 
 
732 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00188388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02510  hypothetical protein  28.65 
 
 
707 aa  203  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1078  hypothetical protein  26.98 
 
 
716 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000205718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0520  hypothetical protein  26.65 
 
 
731 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00489252  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0807  hypothetical protein  27.84 
 
 
720 aa  201  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.661422  normal  0.0291008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2038  hypothetical protein  26.47 
 
 
725 aa  201  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302869  hitchhiker  0.00293045 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1768  dipeptidyl-peptidase 7  26.53 
 
 
721 aa  200  9e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0506828  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2938  hypothetical protein  28.02 
 
 
738 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0761  hypothetical protein  26.8 
 
 
740 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000133423  hitchhiker  0.0000000733664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0573  hypothetical protein  27.22 
 
 
718 aa  198  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3279  hypothetical protein  26.01 
 
 
734 aa  198  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00632369  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3059  hypothetical protein  26.89 
 
 
729 aa  198  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000942986  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0757  hypothetical protein  26.83 
 
 
732 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000601769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0691  dipeptidyl-peptidase 7  26.8 
 
 
732 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000153124  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  26.46 
 
 
941 aa  195  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3249  dipeptidyl-peptidase 7  26.67 
 
 
732 aa  193  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101755  hitchhiker  0.0000935307 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3918  hypothetical protein  26.49 
 
 
732 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3582  hypothetical protein  26.71 
 
 
743 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000436948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4208  hypothetical protein  26.04 
 
 
739 aa  191  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000122811  hitchhiker  0.000560321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01009  hypothetical protein  25.81 
 
 
721 aa  190  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00499323  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3187  hypothetical protein  27.22 
 
 
718 aa  189  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.828747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0712  dipeptidyl-peptidase 7  26.27 
 
 
732 aa  188  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00861513  hitchhiker  0.000040961 
 
 
-
 
NC_002950  PG0491  hypothetical protein  27.12 
 
 
712 aa  183  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0404  dipeptidyl-peptidase 7  24.31 
 
 
714 aa  175  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2431  dipeptidyl-peptidase 7  30.49 
 
 
704 aa  141  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>