More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0607 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  100 
 
 
248 aa  499  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0608  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 
269 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.912503  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 
235 aa  177  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 
240 aa  176  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 
238 aa  174  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 
235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 
230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 
237 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 
232 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
237 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 
235 aa  168  7e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 
234 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40 
 
 
240 aa  168  8e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  38.7 
 
 
239 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  38.7 
 
 
239 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 
227 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  39.3 
 
 
236 aa  167  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.82 
 
 
230 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 
232 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 
236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4388  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 
227 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 
228 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  36.73 
 
 
228 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 
229 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  39.82 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 
221 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  38.05 
 
 
223 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6462  two component transcriptional regulator  39.75 
 
 
249 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.747199 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  37.12 
 
 
233 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 
239 aa  161  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 
244 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 
239 aa  161  8.000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 
232 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  34.93 
 
 
234 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  37.95 
 
 
223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 
233 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 
233 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  36.4 
 
 
233 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  37.95 
 
 
223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  37.17 
 
 
223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  40.82 
 
 
246 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 
233 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0440  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 
230 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 
243 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  37.95 
 
 
223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 
233 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 
223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 
243 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 
244 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 
243 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 
231 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 
233 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  36.4 
 
 
233 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  37.95 
 
 
223 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  37.55 
 
 
250 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 
231 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 
233 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.09 
 
 
237 aa  160  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 
248 aa  159  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 
223 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 
229 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  37.95 
 
 
223 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  37.17 
 
 
223 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  34.5 
 
 
234 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0224  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 
226 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.175792  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  41.59 
 
 
232 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 
235 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 
229 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 
229 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  37.95 
 
 
223 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 
230 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  37.95 
 
 
223 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  39.64 
 
 
241 aa  159  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  39.11 
 
 
239 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 
237 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  37.95 
 
 
223 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  37.95 
 
 
223 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 
230 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 
223 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 
234 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 
239 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 
231 aa  158  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  36.6 
 
 
235 aa  159  6e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  40.69 
 
 
234 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  35.44 
 
 
236 aa  158  7e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 
228 aa  158  9e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  35.53 
 
 
233 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  38.2 
 
 
233 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  38.5 
 
 
239 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0378  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 
245 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0515  two component transcriptional regulator  39.42 
 
 
244 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000767404  normal  0.580599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 
230 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  40.26 
 
 
234 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 
230 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  40 
 
 
241 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>