More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0603 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  100 
 
 
151 aa  314  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  54.05 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  54.05 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  53.38 
 
 
149 aa  167  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  51.68 
 
 
149 aa  156  9e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  51.68 
 
 
149 aa  156  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  48.65 
 
 
149 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  51.68 
 
 
150 aa  150  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  50.33 
 
 
154 aa  148  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  51.37 
 
 
147 aa  147  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  50 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  51.35 
 
 
149 aa  144  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  50 
 
 
140 aa  142  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  50.36 
 
 
158 aa  140  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  50.36 
 
 
148 aa  140  7e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  45.89 
 
 
159 aa  138  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  45.89 
 
 
159 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  48.65 
 
 
149 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  48.95 
 
 
160 aa  137  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  46.75 
 
 
162 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  45.45 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  47.52 
 
 
160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  47.22 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  46.67 
 
 
163 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  45.21 
 
 
171 aa  123  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  42.38 
 
 
154 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  42.38 
 
 
154 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  44.44 
 
 
141 aa  121  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  45.19 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  45.19 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  47.29 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  45.19 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  42.75 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  45.19 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.23 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  45.19 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  45.19 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  45.1 
 
 
150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  45.19 
 
 
163 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.66 
 
 
149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  43.14 
 
 
155 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  45 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  45 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  45 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  43.06 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  44.93 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  42.34 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.44 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  43.75 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  43.41 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0988  NifU family protein  47.62 
 
 
126 aa  114  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  42.03 
 
 
151 aa  114  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  43.41 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2069  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.74 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.420514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  44.12 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21900  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.06 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.86 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.84 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  41.1 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.42 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  42.31 
 
 
144 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  42.57 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  42.45 
 
 
154 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.43 
 
 
151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  43.06 
 
 
160 aa  107  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1070  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.39 
 
 
142 aa  107  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  40 
 
 
145 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.24 
 
 
151 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0499  NifU domain-containing protein  42.75 
 
 
154 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.73 
 
 
163 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.48 
 
 
131 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0207  SUF system FeS assembly protein  45.99 
 
 
140 aa  105  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2958  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.78 
 
 
158 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.13 
 
 
135 aa  105  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.17 
 
 
139 aa  104  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  37.5 
 
 
172 aa  103  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3305  NifU family SUF system FeS assembly protein  44.53 
 
 
158 aa  104  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.5 
 
 
146 aa  103  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  43.17 
 
 
143 aa  102  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5117  NifU domain-containing protein  43.17 
 
 
143 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  43.17 
 
 
143 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4689  NifU family protein  43.17 
 
 
143 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  43.17 
 
 
143 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5085  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  43.17 
 
 
143 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  38.41 
 
 
145 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  43.17 
 
 
143 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  43.17 
 
 
143 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5122  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  43.17 
 
 
143 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4802  NifU family SUF system FeS assembly protein  42.45 
 
 
143 aa  100  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16670  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.19 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0471636  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.31 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3078  NifU family SUF system FeS assembly protein  43.26 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167444  normal  0.201859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.89 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000198269 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1145  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.25 
 
 
178 aa  98.2  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.68 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1676  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.5 
 
 
171 aa  97.8  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610224  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3576  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.88 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.88 
 
 
167 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000288131  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2274  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.64 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.42 
 
 
130 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>