151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0558 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0558  peptidase M50  100 
 
 
372 aa  731    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463996  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  35.2 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  29.78 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  37.82 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3646  peptidase M50  30.51 
 
 
485 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.415625  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  37.1 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3720  peptidase M50  29.94 
 
 
485 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  32.67 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3580  peptidase M50  29.94 
 
 
489 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3312  gamma-glutamyl phosphate reductase GPR  33.52 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1771  peptidase M50  37.69 
 
 
247 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000535238 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  32.5 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  30.32 
 
 
286 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4565  stage IV sporulation protein FB  29.79 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000384784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3701  peptidase M50  31.07 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4292  peptidase M50  25.67 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4180  stage IV sporulation protein FB  28.72 
 
 
286 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4526  stage IV sporulation protein FB  28.72 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.870935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1370  peptidase M50  32.52 
 
 
365 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00911747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4580  stage IV sporulation protein FB  28.72 
 
 
286 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000567867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1355  hypothetical protein  32.52 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4344  stage IV sporulation protein FB  28.19 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1329  membrane metalloprotease  32.52 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4191  stage IV sporulation protein FB  28.72 
 
 
286 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1465  hypothetical protein  32.52 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4678  stage IV sporulation protein FB  28.19 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0277771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1538  hypothetical protein  32.52 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000573699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1608  hypothetical protein  32.52 
 
 
365 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1570  hypothetical protein  32.52 
 
 
365 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0569959  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  30.77 
 
 
344 aa  64.7  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  29.56 
 
 
258 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1328  membrane metalloprotease  32.52 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.826194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3843  hypothetical protein  31.71 
 
 
365 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0912094  hitchhiker  0.00000000235959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4538  stage IV sporulation protein FB  27.66 
 
 
286 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.214848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  34.81 
 
 
373 aa  63.2  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  34.44 
 
 
301 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1502  hypothetical protein  31.71 
 
 
365 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  39.8 
 
 
313 aa  62.8  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  35 
 
 
241 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1166  peptidase M50  33.93 
 
 
366 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3161  peptidase M50  29.52 
 
 
286 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000495345  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  33.57 
 
 
241 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  35 
 
 
241 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  35.29 
 
 
241 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  35.29 
 
 
241 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  35.29 
 
 
241 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  35.43 
 
 
372 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  37.9 
 
 
373 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2980  peptidase M50  27.44 
 
 
393 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0270746  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  31.37 
 
 
375 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  35.04 
 
 
379 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  30.77 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05816  hypothetical protein  35.04 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16220  Zn-dependent protease  37.27 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.276827  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  32.84 
 
 
377 aa  57  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0595  peptidase M50  27.47 
 
 
374 aa  56.6  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4142  peptidase M50  34.45 
 
 
380 aa  57  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.452732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  35.06 
 
 
412 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0686  peptidase M50  33.08 
 
 
390 aa  56.6  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.393797  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  32.59 
 
 
342 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0537  peptidase M50  25.88 
 
 
378 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  35.61 
 
 
286 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  37.7 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  27.87 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  36.52 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0566  hypothetical protein  32.84 
 
 
370 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0828  peptidase M50  25.36 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000017367 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000182  Zn-dependent protease  33.93 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.273834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  30.05 
 
 
362 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3533  peptidase M50  25.36 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0103941  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  31.06 
 
 
337 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0803  peptidase M50  25.36 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3980  peptidase M50  27.96 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0835  peptidase M50  25.36 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  36.05 
 
 
390 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3232  peptidase M50  34.82 
 
 
392 aa  53.1  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  32 
 
 
372 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  31.85 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  36.59 
 
 
359 aa  52.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  29.17 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  38.1 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1818  peptidase M50  38.46 
 
 
302 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  32.54 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  28.79 
 
 
337 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0672  peptidase M50  31.67 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0458569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3167  peptidase M50  31.67 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  34.85 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  33.1 
 
 
415 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  34.17 
 
 
413 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3453  peptidase M50  30.83 
 
 
374 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444039  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3275  peptidase M50  30.83 
 
 
374 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.01208 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0823  hypothetical protein  31.67 
 
 
374 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  36.36 
 
 
396 aa  50.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  35.88 
 
 
412 aa  49.7  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  33.33 
 
 
424 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49052  predicted protein  36.27 
 
 
386 aa  50.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.735615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  30.06 
 
 
371 aa  49.7  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  28.98 
 
 
370 aa  49.7  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  28.35 
 
 
370 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  33.93 
 
 
379 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>