80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0359 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 506 aa  1032    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.57 
 
 		 576 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3519  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  24.34 
 
 		 640 aa  140  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3298  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.77 
 
 		 593 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.679676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4540  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.81 
 
 		 616 aa  133  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  27.36 
 
 		 855 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  29.07 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  26.38 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  30.73 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.33 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.13 
 
 		 315 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  22.6 
 
 		 324 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  26.26 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  23.3 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  26.07 
 
 		 319 aa  67  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  28.9 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  25.97 
 
 		 527 aa  66.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  30.91 
 
 		 563 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  22.45 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  30 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.67 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  26.77 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.96 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  22.98 
 
 		 644 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  26.11 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.78 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  27.07 
 
 		 542 aa  60.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  27.91 
 
 		 344 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  27.78 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.08 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  28.1 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  27.03 
 
 		 326 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  26.64 
 
 		 509 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  28.23 
 
 		 581 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  27.13 
 
 		 450 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  22.04 
 
 		 323 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  25.82 
 
 		 517 aa  54.7  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.94 
 
 		 538 aa  54.7  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  22.78 
 
 		 679 aa  53.5  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  27.94 
 
 		 468 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  29.33 
 
 		 497 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 		 340 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 		 310 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 		 348 aa  50.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.27 
 
 		 385 aa  50.4  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.17 
 
 		 515 aa  50.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  30.77 
 
 		 526 aa  50.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.49 
 
 		 320 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  28.7 
 
 		 464 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  27.93 
 
 		 533 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.44 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  24.31 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  24.67 
 
 		 512 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  32.04 
 
 		 512 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  25.52 
 
 		 383 aa  47  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.67 
 
 		 316 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.57 
 
 		 577 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  25.08 
 
 		 344 aa  47  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.68 
 
 		 558 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  24.3 
 
 		 535 aa  47  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  28.92 
 
 		 556 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.79 
 
 		 541 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.23 
 
 		 546 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  25.48 
 
 		 496 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  25.76 
 
 		 524 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  27.05 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  25.22 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  25.11 
 
 		 313 aa  45.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.37 
 
 		 1088 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.29 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 		 315 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  29.12 
 
 		 519 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  23.47 
 
 		 315 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.48 
 
 		 488 aa  44.3  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  32.29 
 
 		 341 aa  43.9  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  22.74 
 
 		 1186 aa  43.5  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  26.34 
 
 		 345 aa  43.5  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>